More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1625 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 439 aa  885    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  44.19 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  43.93 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  40.71 
 
 		 448 aa  322  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  40.8 
 
 		 443 aa  312  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  40.6 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  39.9 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  43.16 
 
 		 452 aa  295  8e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  40.9 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  41.33 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  43.39 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  44.04 
 
 		 445 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  44.63 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  45.08 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  38.26 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  38.53 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  35.41 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  40.79 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  41.05 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  38.19 
 
 		 467 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  37.57 
 
 		 462 aa  239  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  38.73 
 
 		 463 aa  239  9e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  37.08 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  37.06 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  37.62 
 
 		 464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  41.1 
 
 		 466 aa  236  7e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  37.47 
 
 		 464 aa  236  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  37.56 
 
 		 458 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  37.56 
 
 		 458 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  38.28 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  37.56 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  36.61 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  38.9 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  37.32 
 
 		 458 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  39.67 
 
 		 459 aa  229  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  39.89 
 
 		 478 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  38.72 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  38.12 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  37.24 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  37.09 
 
 		 458 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4045  argininosuccinate lyase  37.04 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  37.67 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  40.61 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  41.28 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 		 499 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  35.68 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  36.75 
 
 		 462 aa  226  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  36.85 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  36.85 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  35.75 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  36.85 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  37.82 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  36.85 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  36.85 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  36.85 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  38.66 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  37.87 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  37.87 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  38.8 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  36.53 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  37.38 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  36.07 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  36.18 
 
 		 491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  33.68 
 
 		 460 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  35.55 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  36.53 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  38.16 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  34.99 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0938  argininosuccinate lyase  33.68 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  36.6 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  39.95 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  41.18 
 
 		 487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  37.05 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 462 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  34.89 
 
 		 458 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  39.58 
 
 		 502 aa  219  8.999999999999998e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00121  argininosuccinate lyase  37.89 
 
 		 462 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  33.55 
 
 		 466 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00111  argininosuccinate lyase  36.27 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.642056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1339  argininosuccinate lyase  36.27 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0013  argininosuccinate lyase  38.78 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  38.36 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00121  argininosuccinate lyase  38.5 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0883  argininosuccinate lyase  33.68 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  37.43 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2017  argininosuccinate lyase  38.67 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  35.66 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2153  argininosuccinate lyase  38.67 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  35.45 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  40.46 
 
 		 465 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  36.93 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1997  argininosuccinate lyase  38.67 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.064974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  37.11 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  36.53 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  37.34 
 
 		 467 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  36.46 
 
 		 462 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>