More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3088 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 		 443 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 445 aa  924    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  65.24 
 
 		 443 aa  616  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  62.3 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  62.92 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  57.92 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  38 
 
 		 448 aa  302  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  39.9 
 
 		 439 aa  299  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  37.24 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  37.24 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  38.02 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  37.8 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  37.31 
 
 		 431 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  38.02 
 
 		 452 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  36.86 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  36.86 
 
 		 464 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  36.86 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  36.54 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  36.6 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  36.6 
 
 		 464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  34.25 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  36.43 
 
 		 441 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  37.03 
 
 		 465 aa  243  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  35.57 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  35.57 
 
 		 464 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  36.62 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  35.79 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  35.31 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  35.31 
 
 		 464 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  34.95 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  37.7 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  36.34 
 
 		 460 aa  237  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  35.86 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0883  argininosuccinate lyase  36.07 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  35.57 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  34.99 
 
 		 467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  35.57 
 
 		 476 aa  233  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  36.78 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0938  argininosuccinate lyase  36.34 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  36.22 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  35.56 
 
 		 467 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  35.56 
 
 		 456 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  37.94 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  36.51 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  35.79 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  35.53 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  34.35 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  34.83 
 
 		 461 aa  230  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  34.35 
 
 		 458 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  37.09 
 
 		 471 aa  229  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  35.62 
 
 		 458 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  35.29 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  36.26 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  34.78 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  34.11 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  34.69 
 
 		 457 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 		 458 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  34.69 
 
 		 457 aa  227  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  34.69 
 
 		 457 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  33.59 
 
 		 472 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  36.54 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  34.92 
 
 		 441 aa  226  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  35.26 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 		 458 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  35.64 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  35.03 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  35.64 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  36.26 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  34.69 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  35.9 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  34.11 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  36.06 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  34.89 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  33.84 
 
 		 458 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  33.56 
 
 		 460 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  34.18 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  33.58 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  34.69 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  35.42 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  35.36 
 
 		 456 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 457 aa  223  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  35.03 
 
 		 474 aa  222  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1940  argininosuccinate lyase  34.18 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  35.87 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  35.5 
 
 		 624 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>