More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1068 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  99.75 
 
 
398 aa  814    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  100 
 
 
398 aa  815    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  45.22 
 
 
448 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  44.19 
 
 
439 aa  342  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  41.13 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  39.23 
 
 
445 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  37.18 
 
 
443 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  38.01 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  37.24 
 
 
445 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  36.57 
 
 
443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  38.13 
 
 
431 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  36.87 
 
 
452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  38.56 
 
 
431 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  36.87 
 
 
452 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 
459 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  36.43 
 
 
462 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  36.19 
 
 
458 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  36.19 
 
 
458 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  36.19 
 
 
458 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1940  argininosuccinate lyase  34.26 
 
 
460 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  36.19 
 
 
458 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  36.19 
 
 
458 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 
457 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 
457 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 
457 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 
457 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  35.5 
 
 
457 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  35.92 
 
 
457 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 
457 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 
457 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  33.92 
 
 
463 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 
457 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  35.5 
 
 
457 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  35.66 
 
 
457 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  35.95 
 
 
457 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  35.95 
 
 
457 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  31.97 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  33.5 
 
 
460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  34.89 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  35.81 
 
 
479 aa  221  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  33.67 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
467 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  34.09 
 
 
466 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  34.32 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  34.95 
 
 
461 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  32.01 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  34.15 
 
 
457 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  34.1 
 
 
462 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
462 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  34.1 
 
 
462 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  34.1 
 
 
462 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  34.86 
 
 
624 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  34.09 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  33.76 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  33.76 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  35.29 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62615  argininosuccinate lyase  35.95 
 
 
464 aa  213  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.57732  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  32.74 
 
 
461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  33.59 
 
 
462 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  32.58 
 
 
459 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  33.59 
 
 
463 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  33.16 
 
 
478 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  31.98 
 
 
458 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  34.58 
 
 
458 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  34.7 
 
 
467 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  34.32 
 
 
624 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  32.37 
 
 
463 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5512  argininosuccinate lyase  32.14 
 
 
462 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  35.79 
 
 
463 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  32.91 
 
 
463 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02914  arginosuccinate lyase (Eurofung)  34.66 
 
 
463 aa  210  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0370046  normal  0.061246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  34.67 
 
 
459 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  31.98 
 
 
465 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  32.84 
 
 
465 aa  209  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  31.54 
 
 
485 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  31.96 
 
 
455 aa  209  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  33.61 
 
 
462 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
464 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
460 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  33.61 
 
 
462 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
469 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00111  argininosuccinate lyase  34.18 
 
 
459 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.24061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  32.35 
 
 
456 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4045  argininosuccinate lyase  34.59 
 
 
470 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  33.93 
 
 
458 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  34.43 
 
 
461 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  35.11 
 
 
464 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  33.16 
 
 
458 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  32.81 
 
 
466 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2153  argininosuccinate lyase  32.52 
 
 
466 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121054  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0013  argininosuccinate lyase  35.07 
 
 
472 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1997  argininosuccinate lyase  32.52 
 
 
466 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.064974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2017  argininosuccinate lyase  32.52 
 
 
466 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178191  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  35.17 
 
 
487 aa  206  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  33.93 
 
 
458 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00111  argininosuccinate lyase  35 
 
 
459 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>