More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00346 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  76.98 
 
 
452 aa  664    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  100 
 
 
431 aa  864    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  77.44 
 
 
452 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  88.6 
 
 
431 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  39.52 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  39.05 
 
 
448 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  44.63 
 
 
439 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  40.72 
 
 
445 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  38.13 
 
 
398 aa  286  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  35.96 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  38.13 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  38.26 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  38.92 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  37.21 
 
 
445 aa  273  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  34.31 
 
 
459 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  36.61 
 
 
464 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  33.67 
 
 
479 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  38.64 
 
 
462 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1940  argininosuccinate lyase  34.02 
 
 
460 aa  219  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  37.4 
 
 
461 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  37.26 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  35.31 
 
 
466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  35.12 
 
 
462 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  35.12 
 
 
462 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  35.18 
 
 
463 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  35.81 
 
 
464 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  34.4 
 
 
478 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  35.32 
 
 
469 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  34.11 
 
 
460 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  34.81 
 
 
475 aa  209  9e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  35.28 
 
 
463 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  31.03 
 
 
458 aa  207  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  37.88 
 
 
474 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  35.42 
 
 
459 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  36.22 
 
 
467 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  35.22 
 
 
467 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  35.12 
 
 
462 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
464 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  34.72 
 
 
468 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  36.25 
 
 
466 aa  202  6e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 
465 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  34.73 
 
 
467 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  35.81 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  33.77 
 
 
464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  34.55 
 
 
464 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  34.55 
 
 
464 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
464 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  33.76 
 
 
456 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
499 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00121  argininosuccinate lyase  32.59 
 
 
462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4157  argininosuccinate lyase  33.43 
 
 
464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.273267 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02914  arginosuccinate lyase (Eurofung)  33.59 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0370046  normal  0.061246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  32.2 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2153  argininosuccinate lyase  33.96 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2017  argininosuccinate lyase  33.96 
 
 
466 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1997  argininosuccinate lyase  33.96 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.064974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  32.9 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
457 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
457 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
457 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
457 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
457 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  32.98 
 
 
464 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  32.55 
 
 
457 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  32.15 
 
 
462 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
457 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
457 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  32.15 
 
 
462 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  32.99 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  32.98 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  32.99 
 
 
458 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  34.11 
 
 
462 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  34.64 
 
 
467 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  32.6 
 
 
467 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  32.04 
 
 
459 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  32.36 
 
 
466 aa  196  8.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  32.99 
 
 
458 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  31.65 
 
 
461 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  32.44 
 
 
491 aa  195  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  32.73 
 
 
458 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  30.58 
 
 
462 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4045  argininosuccinate lyase  34.75 
 
 
470 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  31.39 
 
 
457 aa  194  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  34.53 
 
 
476 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  34.23 
 
 
456 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  32.56 
 
 
457 aa  193  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  32.56 
 
 
457 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  32.56 
 
 
457 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  32.18 
 
 
455 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  33.86 
 
 
476 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  30.07 
 
 
463 aa  192  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  34.16 
 
 
467 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  32.56 
 
 
457 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  30.62 
 
 
441 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>