More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4202 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 443 aa  921    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  69.98 
 
 		 443 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  65.24 
 
 		 445 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  58.92 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  59.21 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  38.65 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  40.9 
 
 		 439 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  36.48 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  36.48 
 
 		 398 aa  282  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  39.25 
 
 		 465 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  35.58 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  38.85 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  35.96 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  35.58 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  38.14 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  37.85 
 
 		 464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  37.73 
 
 		 468 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  38.2 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  35.62 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  37.7 
 
 		 467 aa  252  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  35.59 
 
 		 459 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  36.41 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  35.53 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  35.53 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  36.41 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  36.8 
 
 		 468 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  36.29 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  37.08 
 
 		 464 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  36.63 
 
 		 485 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  35.71 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  38.54 
 
 		 491 aa  249  8e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  34.69 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  39.09 
 
 		 479 aa  249  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  36.15 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  36.93 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  36.04 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  36.66 
 
 		 464 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  37.4 
 
 		 456 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  35.5 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 458 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 458 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  35.93 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  37.2 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  35.38 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  36.02 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  35.5 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  36.29 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  36.98 
 
 		 457 aa  243  6e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  34.31 
 
 		 624 aa  242  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 469 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  35.48 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  36.46 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  34.46 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  34.1 
 
 		 626 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  36 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  36.16 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  35.52 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  37.15 
 
 		 464 aa  240  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  35.73 
 
 		 464 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1940  argininosuccinate lyase  35.81 
 
 		 460 aa  239  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  35.5 
 
 		 470 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  36.29 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  35.77 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  35.14 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  36.97 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  35.92 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.59 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  35.23 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 		 476 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  35.7 
 
 		 467 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  35.42 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  35.48 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 465 aa  237  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  36 
 
 		 459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  33.59 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.84 
 
 		 624 aa  236  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  37.6 
 
 		 467 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  35.75 
 
 		 465 aa  236  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 		 462 aa  235  9e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  35.14 
 
 		 462 aa  236  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>