More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0319 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  98.23 
 
 
452 aa  896    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  76.98 
 
 
431 aa  645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  100 
 
 
452 aa  914    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  76.1 
 
 
431 aa  617  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  40.86 
 
 
448 aa  326  6e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  43.16 
 
 
439 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  37.88 
 
 
426 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  39.95 
 
 
445 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  35.58 
 
 
443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  36.87 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  37.3 
 
 
444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  36.87 
 
 
398 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  38.02 
 
 
445 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  37.21 
 
 
443 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  34.76 
 
 
458 aa  233  6e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  33.84 
 
 
459 aa  232  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  31.78 
 
 
479 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1940  argininosuccinate lyase  36.16 
 
 
460 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  37.93 
 
 
478 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  35.83 
 
 
461 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  35.83 
 
 
462 aa  217  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  35.12 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  36.18 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  35.12 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  37.6 
 
 
474 aa  213  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  33.16 
 
 
460 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  35.27 
 
 
467 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  34.15 
 
 
464 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  35.29 
 
 
469 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  35.25 
 
 
475 aa  209  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  34.95 
 
 
466 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4157  argininosuccinate lyase  34.18 
 
 
464 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  32.33 
 
 
462 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 
466 aa  206  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  34.35 
 
 
441 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  32.99 
 
 
458 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  33.09 
 
 
460 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  34.73 
 
 
467 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  31.94 
 
 
458 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  31.74 
 
 
458 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  35.17 
 
 
467 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 
462 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  33 
 
 
463 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  31.69 
 
 
463 aa  204  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  33.6 
 
 
459 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  35.43 
 
 
464 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  34.21 
 
 
467 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  34.78 
 
 
463 aa  202  9e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  34.65 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  34.63 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  35.43 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0938  argininosuccinate lyase  32.59 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  31.31 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
462 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
462 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  34.74 
 
 
464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02914  arginosuccinate lyase (Eurofung)  33.33 
 
 
463 aa  200  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0370046  normal  0.061246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  34.38 
 
 
464 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  35.61 
 
 
466 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  32.59 
 
 
458 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  36.16 
 
 
460 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  34.21 
 
 
499 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  34.15 
 
 
458 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  34.21 
 
 
464 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  33.17 
 
 
457 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  31.23 
 
 
458 aa  199  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  34.21 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  33.91 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  33.91 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  31.79 
 
 
459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  33.91 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  34.21 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  34.73 
 
 
465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  34.64 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
456 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  35.11 
 
 
465 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
462 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  34.18 
 
 
468 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  33.75 
 
 
457 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  33.75 
 
 
457 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
457 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
457 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
457 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  33.17 
 
 
458 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  33.75 
 
 
457 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  33.25 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  34.47 
 
 
464 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
456 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  28.51 
 
 
462 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
460 aa  194  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  35.99 
 
 
468 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>