More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2723 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  100 
 
 
431 aa  856    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  76.1 
 
 
452 aa  662    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  76.33 
 
 
452 aa  639    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  88.6 
 
 
431 aa  720    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  45.24 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  39.67 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  38.5 
 
 
426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  39.53 
 
 
444 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  41.69 
 
 
445 aa  298  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  36.66 
 
 
443 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  37.88 
 
 
443 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  39.14 
 
 
398 aa  286  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  39.14 
 
 
398 aa  286  7e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  38.08 
 
 
445 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  35.37 
 
 
459 aa  236  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  34.11 
 
 
479 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1940  argininosuccinate lyase  34.64 
 
 
460 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  39.01 
 
 
464 aa  222  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  38.48 
 
 
462 aa  219  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  34.56 
 
 
465 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  36.32 
 
 
469 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  37.14 
 
 
478 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  36.64 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  35.91 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  37.81 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  36.34 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  32.05 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  34.15 
 
 
460 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  35.53 
 
 
475 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  36.24 
 
 
462 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  37.5 
 
 
461 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  36.24 
 
 
462 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  34.13 
 
 
469 aa  210  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4045  argininosuccinate lyase  37.37 
 
 
470 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  35.98 
 
 
467 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  34.49 
 
 
476 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  34.74 
 
 
457 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  35.26 
 
 
467 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  35.96 
 
 
468 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  32.87 
 
 
459 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  34.47 
 
 
457 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  34.56 
 
 
458 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  37.88 
 
 
474 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  34.13 
 
 
462 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  34.3 
 
 
458 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  34.3 
 
 
458 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  35.22 
 
 
464 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04420  argininosuccinate lyase, putative  35.81 
 
 
466 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000251148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  34.48 
 
 
464 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  32.54 
 
 
461 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  35.13 
 
 
491 aa  204  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  27.38 
 
 
463 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4157  argininosuccinate lyase  34.53 
 
 
464 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  36.68 
 
 
462 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  32.89 
 
 
461 aa  203  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  34.04 
 
 
458 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  34.07 
 
 
464 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  35.07 
 
 
466 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  34.04 
 
 
458 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 
466 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  34.46 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  32.61 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  32.61 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  34.75 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  32.49 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  34.48 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00111  argininosuccinate lyase  35.71 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.24061  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  34.81 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  34.96 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
457 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  33.59 
 
 
467 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 
468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 
499 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 
464 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  31.4 
 
 
462 aa  200  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  33.68 
 
 
462 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  33.95 
 
 
464 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 
467 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  33.68 
 
 
462 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  33.7 
 
 
467 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  33.88 
 
 
456 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
455 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62615  argininosuccinate lyase  32.89 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.57732  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  33.95 
 
 
464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  33.59 
 
 
462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02914  arginosuccinate lyase (Eurofung)  35.26 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0370046  normal  0.061246 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  35.15 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  35.15 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  34.88 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  35.15 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  35.15 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  35.15 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  35.15 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  35.33 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>