More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4056 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  100 
 
 
457 aa  935    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  100 
 
 
457 aa  935    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  99.56 
 
 
457 aa  931    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  935    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  68.94 
 
 
645 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  98.91 
 
 
457 aa  925    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  74.78 
 
 
458 aa  689    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  87.75 
 
 
457 aa  820    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  73.9 
 
 
624 aa  688    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  86.21 
 
 
457 aa  801    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  73.9 
 
 
624 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  95.18 
 
 
458 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  99.56 
 
 
457 aa  928    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  100 
 
 
457 aa  935    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  94.96 
 
 
458 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  86.21 
 
 
457 aa  802    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  94.96 
 
 
458 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  89.04 
 
 
457 aa  832    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  71.93 
 
 
624 aa  672    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  89.04 
 
 
457 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  89.25 
 
 
457 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  100 
 
 
457 aa  935    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  94.96 
 
 
458 aa  884    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  73.9 
 
 
457 aa  700    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  93.64 
 
 
457 aa  879    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  86.4 
 
 
457 aa  791    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  68.42 
 
 
626 aa  660    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  95.18 
 
 
458 aa  888    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  99.34 
 
 
457 aa  928    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  85.56 
 
 
457 aa  788    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  67.78 
 
 
456 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  67.18 
 
 
476 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4120  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 
455 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4209  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 
455 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  67.56 
 
 
457 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
455 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3713  argininosuccinate lyase  65.93 
 
 
455 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  67.11 
 
 
456 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4091  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 
455 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
456 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4010  argininosuccinate lyase  65.05 
 
 
455 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0279  argininosuccinate lyase  66.52 
 
 
455 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3705  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 
455 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.597621  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0240  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
455 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3901  argininosuccinate lyase  66.44 
 
 
455 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0206  argininosuccinate lyase  68.44 
 
 
453 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0978  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 
458 aa  538  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  58.8 
 
 
460 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
463 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  53.79 
 
 
441 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
460 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 
462 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
462 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 
459 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 
459 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  48.75 
 
 
441 aa  448  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  49.2 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  47.19 
 
 
466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 
456 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 
464 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 
463 aa  436  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  48.25 
 
 
461 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
464 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 
475 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 
464 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
464 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  50.79 
 
 
463 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
469 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  47.68 
 
 
469 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
468 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
478 aa  433  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  47.12 
 
 
458 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  47.44 
 
 
462 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  51.01 
 
 
463 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
458 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  47.23 
 
 
458 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
458 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  47.9 
 
 
466 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
499 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>