More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4528 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  94.96 
 
 		 457 aa  887    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  94.96 
 
 		 457 aa  887    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  94.96 
 
 		 457 aa  883    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  95.18 
 
 		 457 aa  890    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  87.31 
 
 		 457 aa  814    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  87.31 
 
 		 457 aa  802    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  95.39 
 
 		 457 aa  889    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  94.3 
 
 		 457 aa  884    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  73.46 
 
 		 624 aa  682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  86.87 
 
 		 457 aa  802    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  87.72 
 
 		 457 aa  815    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  90.57 
 
 		 457 aa  852    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  73.46 
 
 		 458 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  94.96 
 
 		 457 aa  887    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  90.35 
 
 		 457 aa  849    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  73.3 
 
 		 624 aa  685    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  88.84 
 
 		 457 aa  832    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  98.69 
 
 		 458 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  98.91 
 
 		 458 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  95.39 
 
 		 457 aa  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  98.69 
 
 		 458 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  94.96 
 
 		 457 aa  887    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  99.34 
 
 		 458 aa  932    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  73.25 
 
 		 457 aa  691    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 458 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  94.96 
 
 		 457 aa  887    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  90.35 
 
 		 457 aa  849    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  71.93 
 
 		 624 aa  672    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  69.15 
 
 		 626 aa  662    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  68.6 
 
 		 645 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  67.71 
 
 		 456 aa  618  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  66.96 
 
 		 476 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  67.93 
 
 		 457 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  67.93 
 
 		 456 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4120  argininosuccinate lyase  65.93 
 
 		 455 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4209  argininosuccinate lyase  65.93 
 
 		 455 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3713  argininosuccinate lyase  65.49 
 
 		 455 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  66.82 
 
 		 455 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  67.26 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4010  argininosuccinate lyase  65.49 
 
 		 455 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4091  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 		 455 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3901  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 		 455 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0279  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 		 455 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3705  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 		 455 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.597621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0206  argininosuccinate lyase  69.04 
 
 		 453 aa  584  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0240  argininosuccinate lyase  66.82 
 
 		 455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0978  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 458 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  59.02 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 		 441 aa  458  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 		 460 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  50.99 
 
 		 468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  47.36 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  47.36 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  51.35 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  46.39 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  46.24 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  50.79 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  47.69 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  47.84 
 
 		 441 aa  435  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  46.49 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  47.46 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  46.93 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  48.35 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  48.43 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  48.43 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  46.43 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  47.8 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 464 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  47.38 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  48.98 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  46.68 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  48.24 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  45.58 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  47.23 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  48.53 
 
 		 467 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  47.58 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  47.58 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  46.56 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  47.58 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  46.76 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>