More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6550 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  69.98 
 
 		 443 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 		 445 aa  641    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 443 aa  913    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  61.49 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  60.27 
 
 		 444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  58.98 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  40.8 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  40 
 
 		 448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  37.18 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  37.18 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  39.37 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  37.21 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  38.92 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  36.48 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  37.94 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  38.34 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  36.08 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  36.6 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  36.08 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  38.46 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  36.08 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  37.22 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  39.39 
 
 		 479 aa  243  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  37.17 
 
 		 476 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  36.6 
 
 		 464 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  35.82 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  35.95 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  35.82 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  35.26 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  37.53 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 		 468 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  39.02 
 
 		 464 aa  239  8e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  38.46 
 
 		 457 aa  239  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0883  argininosuccinate lyase  37.6 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  36.46 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  38.5 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  34.33 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  35.05 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  38.19 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  39.56 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  37.06 
 
 		 460 aa  237  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 458 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  39.07 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  37.11 
 
 		 467 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  36.96 
 
 		 461 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  36.76 
 
 		 464 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 457 aa  236  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  36.29 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  36.29 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  37.98 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  37.13 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  37.7 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  35.99 
 
 		 471 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1940  argininosuccinate lyase  36.97 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0938  argininosuccinate lyase  37.06 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  35.99 
 
 		 471 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  37.26 
 
 		 457 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  34.97 
 
 		 463 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  35.03 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  34.96 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  35.99 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  35.31 
 
 		 459 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.99 
 
 		 624 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  37.26 
 
 		 458 aa  228  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  35.99 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  34.53 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  36.9 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  34.61 
 
 		 624 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  35.56 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  35.56 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  35.71 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  34.88 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  33.83 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  35.34 
 
 		 467 aa  227  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  35.64 
 
 		 465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  36.87 
 
 		 455 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  35.79 
 
 		 456 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  36.6 
 
 		 624 aa  226  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  34.62 
 
 		 469 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  34.62 
 
 		 469 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  34.62 
 
 		 469 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>