More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2309 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2309  L-serine dehydratase 1  100 
 
 		 473 aa  963    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  52.62 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  52.4 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  55.24 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  54.92 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  55.14 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  54.05 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  54.45 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  53.83 
 
 		 458 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  52.62 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  53.61 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  53.83 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  52.74 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  52.8 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  53.15 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  52.21 
 
 		 450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  54.05 
 
 		 458 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  52.8 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  52.29 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  51.79 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  52.06 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  52.29 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  51.97 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  53.59 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  49.24 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  51.63 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  52.05 
 
 		 460 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  52.93 
 
 		 489 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  51.96 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  51.74 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  51.06 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  50.54 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  52.02 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  52.72 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3251  L-serine ammonia-lyase  52.59 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  52.92 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  51.62 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  52.81 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3280  L-serine dehydratase 1  51.19 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  52.38 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  49.68 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0131  L-serine ammonia-lyase  52.59 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  52.59 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  52.37 
 
 		 462 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  48.92 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  48.92 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  52.8 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  52.6 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0141  L-serine dehydratase 1  52.8 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  52.37 
 
 		 462 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  48.92 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  49.03 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  52.59 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  49.47 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3931  L-serine ammonia-lyase  52.59 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.706313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  48.48 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  50.43 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  48.27 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2991  L-serine ammonia-lyase  52.37 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  52.37 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3056  L-serine ammonia-lyase  52.37 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.541658  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  50.87 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0518  L-serine dehydratase 1  52.04 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166535  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  48.48 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  48.48 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4002  L-serine ammonia-lyase  52.37 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3314  L-serine ammonia-lyase  52.37 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1546  L-serine ammonia-lyase  52.37 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  48.48 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  48.48 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  49.13 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  50.33 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  49.78 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  49.89 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  48.05 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  49.45 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  49.03 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  49.35 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  52.06 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1304  L-serine dehydratase 1  50.85 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039374  normal  0.309635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  50.87 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  51.43 
 
 		 453 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0770  L-serine deaminase  48.77 
 
 		 486 aa  418  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0687547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  48.7 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  48.68 
 
 		 456 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  48.68 
 
 		 456 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  49.78 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  51.09 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  49.78 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  49.78 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  49.78 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  49.78 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  49.12 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  49.78 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  49.78 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  47.45 
 
 		 456 aa  415  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  49.89 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  49.89 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  49.78 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  50.98 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>