More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2808 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2808  competence protein ComM, putative  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00197061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2719  competence protein ComM, putative  63.44 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  62.9 
 
 		 511 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  59.36 
 
 		 511 aa  247  9e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  52.49 
 
 		 509 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  52.49 
 
 		 509 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  56.11 
 
 		 512 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  54.1 
 
 		 554 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  50.68 
 
 		 390 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0280  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.68 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0115  Mg chelatase-related protein  48.42 
 
 		 313 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000542207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3069  magnesium chelatase, ChlI subunit  51.58 
 
 		 308 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0159361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  46.4 
 
 		 508 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  53.18 
 
 		 520 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  47.03 
 
 		 510 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  46.61 
 
 		 512 aa  201  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  48.2 
 
 		 513 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  50.68 
 
 		 504 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  46.61 
 
 		 510 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  47.06 
 
 		 508 aa  195  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  43.24 
 
 		 512 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  43.36 
 
 		 516 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3685  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.32 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00933142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  47.51 
 
 		 509 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  43.75 
 
 		 512 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  44.59 
 
 		 512 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0214  magnesium chelatase ChlI subunit  42.08 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  47.49 
 
 		 505 aa  188  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  47.3 
 
 		 504 aa  187  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  45.29 
 
 		 513 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  47.32 
 
 		 509 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  42.08 
 
 		 509 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  41.18 
 
 		 509 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  43.36 
 
 		 518 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  45.66 
 
 		 505 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  42.99 
 
 		 509 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  42.99 
 
 		 509 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  40.64 
 
 		 516 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  43.84 
 
 		 505 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  45.25 
 
 		 511 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  42.48 
 
 		 518 aa  177  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  42.53 
 
 		 509 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  42.34 
 
 		 514 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  40.54 
 
 		 512 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  43.5 
 
 		 513 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  42.34 
 
 		 509 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  39.64 
 
 		 511 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  50.52 
 
 		 514 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  39.38 
 
 		 518 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  42.15 
 
 		 513 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  44.34 
 
 		 506 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  42.73 
 
 		 506 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  39.64 
 
 		 512 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  42.47 
 
 		 507 aa  175  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  40.71 
 
 		 518 aa  175  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.3 
 
 		 499 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  49.77 
 
 		 506 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  39.46 
 
 		 510 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  44.59 
 
 		 512 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  46.3 
 
 		 501 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  42.47 
 
 		 506 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  42.01 
 
 		 509 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  41.1 
 
 		 506 aa  168  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  47.25 
 
 		 496 aa  167  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  41.07 
 
 		 512 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  40.36 
 
 		 507 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  39.91 
 
 		 507 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  46.79 
 
 		 497 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  49.32 
 
 		 497 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  38.74 
 
 		 513 aa  163  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  38.91 
 
 		 501 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 510 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  38.91 
 
 		 501 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0215  ComM-related protein  41.28 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.888279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  41.41 
 
 		 507 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  43.58 
 
 		 495 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  41.85 
 
 		 511 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  42.49 
 
 		 510 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  37.1 
 
 		 506 aa  157  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  41.36 
 
 		 511 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  47.25 
 
 		 498 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  36.04 
 
 		 512 aa  155  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  35.75 
 
 		 509 aa  155  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  42.6 
 
 		 512 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6032  putative Mg chelatase-like protein  46.46 
 
 		 357 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  45.74 
 
 		 504 aa  154  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  46.67 
 
 		 534 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  38.91 
 
 		 504 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  45.05 
 
 		 525 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  45.45 
 
 		 506 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0412  Mg chelatase-related protein  46.45 
 
 		 523 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0124  Mg(2+) chelatase family protein  43.04 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  44.29 
 
 		 497 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  42.15 
 
 		 512 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  40.85 
 
 		 503 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  40.85 
 
 		 503 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  40.85 
 
 		 503 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  43.17 
 
 		 510 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  46.52 
 
 		 569 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  45 
 
 		 502 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>