More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0215 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0215  ComM-related protein  100 
 
 		 284 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.888279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  59.86 
 
 		 507 aa  349  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  60.21 
 
 		 507 aa  349  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  60 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  63.03 
 
 		 510 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  59.65 
 
 		 507 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  60.28 
 
 		 507 aa  341  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  60.28 
 
 		 507 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  59.93 
 
 		 507 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  60.21 
 
 		 507 aa  334  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  59.58 
 
 		 496 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  60.84 
 
 		 504 aa  332  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  58.25 
 
 		 505 aa  331  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  57.68 
 
 		 508 aa  331  8e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  56.94 
 
 		 509 aa  331  8e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  59.65 
 
 		 508 aa  330  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  58.8 
 
 		 508 aa  328  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  59.79 
 
 		 508 aa  328  8e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  58.56 
 
 		 497 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  58.54 
 
 		 507 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  58.36 
 
 		 510 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  57.29 
 
 		 509 aa  325  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6032  putative Mg chelatase-like protein  58.9 
 
 		 357 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  56.76 
 
 		 497 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  59.01 
 
 		 506 aa  323  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  56.18 
 
 		 506 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  61.05 
 
 		 498 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  54.06 
 
 		 506 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  54.06 
 
 		 516 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  54.06 
 
 		 506 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  54.06 
 
 		 506 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  54.06 
 
 		 516 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  54.06 
 
 		 506 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  57.69 
 
 		 506 aa  319  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  57.29 
 
 		 510 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  57.49 
 
 		 508 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  57.49 
 
 		 508 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  53.71 
 
 		 506 aa  318  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  53.71 
 
 		 506 aa  318  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  57.14 
 
 		 508 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  59.3 
 
 		 497 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3653  Mg chelatase, subunit ChlI  57.04 
 
 		 503 aa  318  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  53.71 
 
 		 506 aa  316  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  57.84 
 
 		 506 aa  316  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  56.75 
 
 		 508 aa  315  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  56.79 
 
 		 508 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  57.24 
 
 		 508 aa  315  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  55.9 
 
 		 509 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  57.24 
 
 		 508 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  56.29 
 
 		 506 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  56.79 
 
 		 506 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  56.9 
 
 		 508 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  54.06 
 
 		 506 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  54.06 
 
 		 506 aa  311  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  54.06 
 
 		 506 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  54.06 
 
 		 506 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0392  Mg chelatase, subunit ChlI  56.83 
 
 		 504 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  57.95 
 
 		 503 aa  309  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  55.56 
 
 		 506 aa  309  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  56.1 
 
 		 507 aa  308  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  53.71 
 
 		 506 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  55.83 
 
 		 525 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  55.59 
 
 		 507 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  58.6 
 
 		 516 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  57.24 
 
 		 503 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  55.83 
 
 		 498 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  58.3 
 
 		 501 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  52.92 
 
 		 516 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  55.44 
 
 		 508 aa  300  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  56.79 
 
 		 496 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  53.09 
 
 		 530 aa  299  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  57.48 
 
 		 497 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  56.94 
 
 		 495 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  52.26 
 
 		 516 aa  295  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  59.85 
 
 		 485 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  56.45 
 
 		 504 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  57.89 
 
 		 496 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  53.38 
 
 		 510 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  58.16 
 
 		 496 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  52.54 
 
 		 513 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  58.16 
 
 		 496 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  51.6 
 
 		 511 aa  286  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  55.36 
 
 		 534 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  54.39 
 
 		 512 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  57.95 
 
 		 529 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  52.27 
 
 		 528 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  51.95 
 
 		 528 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  51.95 
 
 		 528 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  51.95 
 
 		 528 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  51.95 
 
 		 528 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  51.95 
 
 		 528 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  51.95 
 
 		 528 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  48.94 
 
 		 549 aa  282  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  53.2 
 
 		 569 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  52.29 
 
 		 526 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  52.65 
 
 		 517 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  50.48 
 
 		 523 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  52.01 
 
 		 515 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  52.6 
 
 		 528 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2923  Mg chelatase, subunit ChlI  51.27 
 
 		 536 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>