More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0115 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0115  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000542207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  69.69 
 
 		 509 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  68.18 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3069  magnesium chelatase, ChlI subunit  65.89 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0159361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  66.78 
 
 		 390 aa  374  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0280  magnesium chelatase, ChlI subunit  64.71 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  66.08 
 
 		 509 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  56.79 
 
 		 512 aa  335  9e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  55.75 
 
 		 510 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  57.49 
 
 		 510 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  56.79 
 
 		 508 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0214  magnesium chelatase ChlI subunit  51.79 
 
 		 309 aa  320  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  55.86 
 
 		 513 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  51.21 
 
 		 512 aa  313  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  53.79 
 
 		 513 aa  311  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  57.09 
 
 		 511 aa  308  8e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  51.22 
 
 		 509 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  51.22 
 
 		 509 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  50.35 
 
 		 512 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  50.87 
 
 		 509 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  53.47 
 
 		 511 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  50.35 
 
 		 512 aa  298  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  49.83 
 
 		 509 aa  297  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  49.48 
 
 		 509 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  51.39 
 
 		 514 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  50.86 
 
 		 509 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  49.48 
 
 		 516 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  50.17 
 
 		 510 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  48.96 
 
 		 511 aa  291  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  52.76 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  49.66 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  49.48 
 
 		 513 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  51.7 
 
 		 505 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  50.17 
 
 		 509 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  52.43 
 
 		 520 aa  287  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  47.06 
 
 		 512 aa  287  2e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  49.83 
 
 		 509 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  49.48 
 
 		 513 aa  283  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  49.31 
 
 		 508 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  49.31 
 
 		 512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  51.39 
 
 		 512 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  47.62 
 
 		 516 aa  282  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  49.83 
 
 		 513 aa  281  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  51.22 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  47.12 
 
 		 518 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  47.62 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  48.29 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  46.78 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  48.97 
 
 		 518 aa  271  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  49.31 
 
 		 506 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  52.9 
 
 		 514 aa  268  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  51.03 
 
 		 501 aa  268  8e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  51.75 
 
 		 506 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  48.28 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  46.21 
 
 		 512 aa  261  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  48.25 
 
 		 504 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  47.92 
 
 		 506 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  46.18 
 
 		 504 aa  256  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  46.53 
 
 		 507 aa  255  8e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.44 
 
 		 499 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3685  magnesium chelatase, ChlI subunit  63.64 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00933142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  48.75 
 
 		 505 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  46.39 
 
 		 507 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  45.36 
 
 		 507 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  50 
 
 		 497 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  47.75 
 
 		 511 aa  245  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  48.07 
 
 		 505 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  44.67 
 
 		 507 aa  245  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  42.9 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  42.9 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  45.67 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  42.9 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  47.26 
 
 		 512 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  45 
 
 		 519 aa  242  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6032  putative Mg chelatase-like protein  50 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  43.65 
 
 		 502 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  50.34 
 
 		 504 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 510 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  45.83 
 
 		 503 aa  239  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  42.4 
 
 		 554 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  45.55 
 
 		 508 aa  239  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  45.45 
 
 		 506 aa  238  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5963  Mg chelatase, subunit ChlI  51.39 
 
 		 525 aa  238  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  47.6 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  47.4 
 
 		 509 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  45.8 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3674  Mg chelatase, subunit ChlI  49.83 
 
 		 507 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.411855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  46.53 
 
 		 506 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  48.61 
 
 		 497 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  44.64 
 
 		 506 aa  235  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  43.08 
 
 		 503 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  45.64 
 
 		 508 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  39.73 
 
 		 506 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  43.05 
 
 		 507 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  45.64 
 
 		 508 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  47.04 
 
 		 510 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  48.9 
 
 		 485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.92 
 
 		 505 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  45.64 
 
 		 508 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  45.64 
 
 		 508 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>