More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3685 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3685  magnesium chelatase, ChlI subunit  100 
 
 		 232 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00933142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  96.33 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  74.77 
 
 		 509 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  74.31 
 
 		 509 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  72.02 
 
 		 390 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3069  magnesium chelatase, ChlI subunit  74.09 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0159361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0280  magnesium chelatase, ChlI subunit  69.72 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0115  Mg chelatase-related protein  64.22 
 
 		 313 aa  275  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000542207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  56.88 
 
 		 508 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  55.96 
 
 		 510 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  52.16 
 
 		 509 aa  232  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  51.35 
 
 		 512 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  52.29 
 
 		 509 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  52.29 
 
 		 509 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  51.29 
 
 		 509 aa  224  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  50.68 
 
 		 513 aa  222  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  49.54 
 
 		 509 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  51.91 
 
 		 509 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  51.36 
 
 		 510 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  50.45 
 
 		 520 aa  214  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  47.84 
 
 		 516 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  48.66 
 
 		 508 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  51.13 
 
 		 513 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  46.12 
 
 		 512 aa  210  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  46.12 
 
 		 509 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0214  magnesium chelatase ChlI subunit  49.36 
 
 		 309 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  47.49 
 
 		 512 aa  207  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 509 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  47.73 
 
 		 510 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  44.29 
 
 		 512 aa  202  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  44.59 
 
 		 509 aa  201  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.58 
 
 		 513 aa  200  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  43.84 
 
 		 511 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  48.18 
 
 		 505 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  46.26 
 
 		 505 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2808  competence protein ComM, putative  47.32 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00197061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  45.91 
 
 		 513 aa  198  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  45.66 
 
 		 514 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  45.66 
 
 		 512 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  47.21 
 
 		 501 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  47.41 
 
 		 504 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  47.06 
 
 		 505 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  44.75 
 
 		 512 aa  194  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  47.73 
 
 		 513 aa  194  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  43.89 
 
 		 512 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  47.53 
 
 		 511 aa  190  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  45.74 
 
 		 518 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  49.31 
 
 		 497 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  44.4 
 
 		 506 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  43.05 
 
 		 518 aa  188  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  44.39 
 
 		 516 aa  188  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  48.2 
 
 		 512 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  47.93 
 
 		 496 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  46.61 
 
 		 511 aa  186  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 		 514 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0215  ComM-related protein  47.03 
 
 		 284 aa  185  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.888279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  43.95 
 
 		 518 aa  185  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 510 aa  185  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  48.07 
 
 		 511 aa  184  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  42.57 
 
 		 530 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  46.19 
 
 		 507 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  47.93 
 
 		 497 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  44.7 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  40.18 
 
 		 512 aa  180  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  44.39 
 
 		 518 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  45.89 
 
 		 510 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  44.59 
 
 		 512 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0124  Mg(2+) chelatase family protein  46.88 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  41.55 
 
 		 507 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  46.54 
 
 		 495 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  41.74 
 
 		 507 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  46.32 
 
 		 497 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  45.99 
 
 		 504 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  40.54 
 
 		 506 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  40.89 
 
 		 507 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  45.91 
 
 		 525 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  40.81 
 
 		 506 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  46.93 
 
 		 510 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  42.47 
 
 		 506 aa  174  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  43.97 
 
 		 504 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2719  competence protein ComM, putative  47.03 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  42.37 
 
 		 499 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  39.63 
 
 		 503 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  39.63 
 
 		 503 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  39.63 
 
 		 503 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  48.78 
 
 		 485 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  45.66 
 
 		 507 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  46.12 
 
 		 512 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  41.55 
 
 		 507 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  46.58 
 
 		 512 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  43.78 
 
 		 498 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6032  putative Mg chelatase-like protein  47.19 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  45.29 
 
 		 511 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  45.06 
 
 		 508 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  44.75 
 
 		 506 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  43.84 
 
 		 511 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  41.95 
 
 		 516 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  47.47 
 
 		 506 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  44.55 
 
 		 510 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  47 
 
 		 498 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>