More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2719 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2719  competence protein ComM, putative  100 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2808  competence protein ComM, putative  63.44 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00197061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  58.91 
 
 		 554 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  58.4 
 
 		 511 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  58.23 
 
 		 511 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  55.9 
 
 		 512 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  48.31 
 
 		 390 aa  208  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  48.05 
 
 		 509 aa  205  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  49.34 
 
 		 510 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.78 
 
 		 513 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0115  Mg chelatase-related protein  47.6 
 
 		 313 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000542207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  48.48 
 
 		 509 aa  198  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  45.29 
 
 		 508 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0280  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.6 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  41.95 
 
 		 512 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  50.66 
 
 		 504 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3069  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.91 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0159361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.04 
 
 		 513 aa  187  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  44.54 
 
 		 513 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  45.05 
 
 		 510 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  44.16 
 
 		 509 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  43.17 
 
 		 516 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  45.53 
 
 		 505 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  46.26 
 
 		 518 aa  182  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  42.86 
 
 		 513 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  44.54 
 
 		 505 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  43.64 
 
 		 509 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  43.64 
 
 		 509 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  48.88 
 
 		 505 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  42.8 
 
 		 508 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  45.73 
 
 		 520 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  39.66 
 
 		 512 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  43.05 
 
 		 514 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0214  magnesium chelatase ChlI subunit  41.1 
 
 		 309 aa  175  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  46.72 
 
 		 509 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  40.81 
 
 		 512 aa  175  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  43.72 
 
 		 509 aa  174  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  39.91 
 
 		 511 aa  174  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  44.05 
 
 		 518 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  38.96 
 
 		 509 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  44.54 
 
 		 509 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3685  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.03 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00933142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  42.8 
 
 		 509 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  39.24 
 
 		 512 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  43.17 
 
 		 518 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  44.54 
 
 		 504 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  48.92 
 
 		 499 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  39.46 
 
 		 512 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  39.46 
 
 		 512 aa  168  7e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  50.22 
 
 		 506 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  40.18 
 
 		 513 aa  168  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  43.46 
 
 		 511 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  43.5 
 
 		 512 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  43.61 
 
 		 509 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  47.5 
 
 		 514 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  37.13 
 
 		 512 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  40.53 
 
 		 518 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  41.63 
 
 		 506 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  43.83 
 
 		 512 aa  161  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  41.2 
 
 		 516 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  38.29 
 
 		 506 aa  161  9e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  38.94 
 
 		 510 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  38.57 
 
 		 507 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  36.77 
 
 		 509 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  48.13 
 
 		 525 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  39.22 
 
 		 507 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  42.54 
 
 		 496 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  44.7 
 
 		 485 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  37.61 
 
 		 501 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  43.72 
 
 		 501 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  37.61 
 
 		 501 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  49.29 
 
 		 498 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  38.29 
 
 		 506 aa  151  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  42.62 
 
 		 512 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  46.45 
 
 		 497 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  39.22 
 
 		 506 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  36.04 
 
 		 506 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  39.66 
 
 		 507 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  40.26 
 
 		 507 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  46.45 
 
 		 497 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  42.19 
 
 		 512 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  39.44 
 
 		 530 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  42.92 
 
 		 505 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  39.41 
 
 		 506 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0215  ComM-related protein  39.11 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.888279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  40.09 
 
 		 509 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  43.46 
 
 		 512 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  46.22 
 
 		 506 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  39.19 
 
 		 500 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  45.97 
 
 		 506 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  40.68 
 
 		 509 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  39.58 
 
 		 508 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  41.77 
 
 		 512 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  43.56 
 
 		 504 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  38.05 
 
 		 511 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  45.8 
 
 		 512 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  42.44 
 
 		 500 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  46.45 
 
 		 497 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  40.91 
 
 		 508 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  40.89 
 
 		 507 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>