More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0214 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0214  magnesium chelatase ChlI subunit  100 
 
 
309 aa  619  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0115  Mg chelatase-related protein  51.79 
 
 
313 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000542207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  53.85 
 
 
512 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  54.55 
 
 
509 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  56.99 
 
 
510 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  52 
 
 
509 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3069  magnesium chelatase, ChlI subunit  51.8 
 
 
308 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0159361  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  51.55 
 
 
390 aa  299  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0280  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.17 
 
 
309 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
516 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  52.45 
 
 
509 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  51.75 
 
 
509 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  49.83 
 
 
513 aa  289  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  51.75 
 
 
509 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  51.22 
 
 
512 aa  288  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  51.05 
 
 
512 aa  288  8e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  51.05 
 
 
509 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  50.87 
 
 
509 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  52.96 
 
 
509 aa  285  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  51.97 
 
 
513 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  49.14 
 
 
509 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  50.18 
 
 
509 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  50.35 
 
 
510 aa  278  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  51.75 
 
 
509 aa  277  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  48.26 
 
 
513 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  49.49 
 
 
518 aa  276  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  48.8 
 
 
505 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  50.52 
 
 
518 aa  276  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  50.71 
 
 
501 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  48.6 
 
 
511 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  49.3 
 
 
514 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  51.79 
 
 
505 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  48.77 
 
 
506 aa  272  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  48.61 
 
 
510 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
518 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  48.43 
 
 
512 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  51.79 
 
 
505 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  46.69 
 
 
512 aa  269  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  48.8 
 
 
506 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  49.65 
 
 
508 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  47.74 
 
 
513 aa  265  5.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  46.85 
 
 
509 aa  265  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  47.64 
 
 
516 aa  265  7e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
512 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  48.26 
 
 
513 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  47.39 
 
 
507 aa  263  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  48.94 
 
 
504 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  48.78 
 
 
506 aa  262  6e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  47.97 
 
 
518 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  48.79 
 
 
508 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  44.6 
 
 
520 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  49.83 
 
 
506 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  45.99 
 
 
512 aa  258  8e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  46.38 
 
 
512 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  45.39 
 
 
512 aa  256  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  46.59 
 
 
508 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  47.18 
 
 
508 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  47.64 
 
 
507 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  47.18 
 
 
504 aa  255  6e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  47.6 
 
 
508 aa  255  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  47.75 
 
 
509 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  47.6 
 
 
508 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  47.6 
 
 
508 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  46.9 
 
 
499 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  44.72 
 
 
507 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  45.77 
 
 
508 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  45.67 
 
 
507 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  46.15 
 
 
507 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  49.22 
 
 
514 aa  248  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  45.77 
 
 
508 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  45.42 
 
 
508 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  45.42 
 
 
508 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  45.3 
 
 
748 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  45.99 
 
 
506 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  43.64 
 
 
506 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  45.96 
 
 
506 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  45.83 
 
 
514 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  49.48 
 
 
508 aa  245  6.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  45.45 
 
 
507 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  47.8 
 
 
507 aa  244  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  47.57 
 
 
511 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  44.91 
 
 
510 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  46.13 
 
 
505 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  45.64 
 
 
511 aa  242  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  46.02 
 
 
507 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  45.94 
 
 
496 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  46.4 
 
 
504 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  45.89 
 
 
509 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  46.48 
 
 
506 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  47.74 
 
 
509 aa  238  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  46.01 
 
 
497 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  46.15 
 
 
501 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  46.15 
 
 
501 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3653  Mg chelatase, subunit ChlI  45.61 
 
 
503 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  44.88 
 
 
495 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  45.99 
 
 
506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  45.83 
 
 
511 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  46.01 
 
 
498 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  45.14 
 
 
507 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  44.14 
 
 
504 aa  231  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>