More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3069 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3069  magnesium chelatase, ChlI subunit  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0159361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  86.46 
 
 		 509 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  82.29 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0280  magnesium chelatase, ChlI subunit  73.26 
 
 		 309 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  70.93 
 
 		 390 aa  431  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  77.43 
 
 		 509 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0115  Mg chelatase-related protein  65.89 
 
 		 313 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000542207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  61.11 
 
 		 510 aa  358  9e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  58.33 
 
 		 508 aa  342  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  58.33 
 
 		 510 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  56.1 
 
 		 512 aa  335  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  57.59 
 
 		 513 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  57.29 
 
 		 509 aa  334  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  51.56 
 
 		 512 aa  328  6e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  55.9 
 
 		 509 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  53.29 
 
 		 512 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  54.17 
 
 		 509 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  55.9 
 
 		 509 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  56.25 
 
 		 513 aa  326  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  58.13 
 
 		 511 aa  322  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  55.05 
 
 		 509 aa  319  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  50.69 
 
 		 512 aa  318  6e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  51.72 
 
 		 512 aa  316  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  53.79 
 
 		 513 aa  315  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  53.63 
 
 		 520 aa  315  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  52.25 
 
 		 514 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  50.69 
 
 		 513 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  49.83 
 
 		 511 aa  313  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0214  magnesium chelatase ChlI subunit  51.8 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  53.82 
 
 		 508 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  52.04 
 
 		 518 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  54.17 
 
 		 509 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  52.72 
 
 		 518 aa  311  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  51.56 
 
 		 513 aa  310  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  51.04 
 
 		 512 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  53.42 
 
 		 518 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  50.17 
 
 		 509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  51.36 
 
 		 516 aa  309  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  51.57 
 
 		 516 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  51.7 
 
 		 518 aa  308  8e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  53.29 
 
 		 511 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  55.4 
 
 		 509 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  52.6 
 
 		 510 aa  305  7e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  48.44 
 
 		 512 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3685  magnesium chelatase, ChlI subunit  74.09 
 
 		 232 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00933142  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  49.65 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  51.39 
 
 		 505 aa  298  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  51.04 
 
 		 504 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  53.82 
 
 		 501 aa  287  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  50.51 
 
 		 506 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  51.74 
 
 		 512 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  48.45 
 
 		 512 aa  285  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  49.13 
 
 		 506 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  54.23 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  47.22 
 
 		 506 aa  278  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  49.83 
 
 		 511 aa  276  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  48.44 
 
 		 507 aa  275  7e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  48.12 
 
 		 504 aa  275  7e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  49.12 
 
 		 505 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  47.95 
 
 		 506 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  49.46 
 
 		 505 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  48.96 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  50 
 
 		 505 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.26 
 
 		 499 aa  265  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  48.4 
 
 		 507 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  46.87 
 
 		 554 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  46.2 
 
 		 507 aa  262  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  47.69 
 
 		 507 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  48.28 
 
 		 512 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  48.62 
 
 		 508 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  47.1 
 
 		 507 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  45.21 
 
 		 519 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 510 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  52.73 
 
 		 511 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  47.7 
 
 		 514 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 506 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  48.62 
 
 		 525 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  47.35 
 
 		 748 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  47.39 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  50.53 
 
 		 504 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1762  Mg chelatase, subunit ChlI  46.18 
 
 		 497 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000904933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  47.75 
 
 		 511 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  47.74 
 
 		 496 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  47.74 
 
 		 497 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  48.01 
 
 		 510 aa  248  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  46.53 
 
 		 512 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  48.58 
 
 		 495 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  48.08 
 
 		 497 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0215  ComM-related protein  47.59 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.888279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  49.34 
 
 		 510 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  46.88 
 
 		 512 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  46.18 
 
 		 512 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  48.28 
 
 		 509 aa  245  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  46.71 
 
 		 508 aa  245  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  44.25 
 
 		 502 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  48.33 
 
 		 485 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  45.83 
 
 		 512 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  43.9 
 
 		 503 aa  242  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  44.79 
 
 		 510 aa  242  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  43.99 
 
 		 511 aa  242  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>