286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1236 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1236  exsB protein  100 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0591  exsB protein  60.93 
 
 		 219 aa  254  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1755  exsB protein  56.22 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  44.75 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  40.53 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  40.35 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  38.77 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  39.21 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  39.21 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  39.65 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  38.97 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  39.91 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  34.91 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  33.79 
 
 		 484 aa  126  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  37.04 
 
 		 224 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  32.72 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  36.82 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  35.07 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  32.52 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  30 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  32.14 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  32.87 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  30.73 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  33.04 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  36.28 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  31.02 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  32.71 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  30.41 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  35.68 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  35.14 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  35.11 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  28.84 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  35.4 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  32.29 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  34.06 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  36.09 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  33.93 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  37.9 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  34.13 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  35.29 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  33.18 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  34.7 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  35.48 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  31.84 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  31.39 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  28.31 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  33.64 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  35.19 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  30.73 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  29.58 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  32.14 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  35.48 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  33.18 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  30.48 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  28.77 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  34.27 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  33.8 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  33.92 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  30.59 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  33.78 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  33.49 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  30.91 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  28.77 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  33.33 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  34.07 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  29.44 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  34.07 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  33.33 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  34.51 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  29.52 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  32.54 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  37.85 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  27.31 
 
 		 256 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  29.49 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  32.74 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  31.02 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  32.29 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  32.14 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  31.34 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  34.12 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  33.18 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  32.29 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  33.78 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  32.29 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  30.37 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  34.68 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  32.29 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  35.43 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  33.48 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1261  exsB protein  31.58 
 
 		 502 aa  96.7  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2870  exsB protein  32.06 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0558  queuosine biosynthesis protein QueC  32.86 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3062  exsB protein  33.17 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  33.33 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 285 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  28.84 
 
 		 259 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3165  exsB protein  31.9 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.6328  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  29.95 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0480  queuosine biosynthesis protein QueC  32.7 
 
 		 231 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>