More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0137 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  64.47 
 
 		 233 aa  315  5e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1755  exsB protein  44.64 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  43.78 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  40.52 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  43.35 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  41.2 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0591  exsB protein  40.64 
 
 		 219 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  37.93 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1236  exsB protein  38.77 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  39.39 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  36.44 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  31.86 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  35.09 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  34.65 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  34.63 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  33.77 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  35.81 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  35.37 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  36.05 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  32.02 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  32.02 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  32.61 
 
 		 224 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  32.46 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  33.33 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  33.19 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  32.89 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  32.61 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  35.87 
 
 		 484 aa  132  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  31.47 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  32.03 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  31.28 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  34.8 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  32.89 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0547  exsB protein  35.24 
 
 		 469 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  35.96 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  31.48 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  34.51 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  34.67 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  31.86 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  32.31 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  34.4 
 
 		 218 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  30.36 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  33.33 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  32.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  32.14 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  31.44 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  32 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  33.04 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  33.92 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  33.78 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  34.07 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  34.22 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  31.42 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  32.74 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  33.62 
 
 		 224 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  33.77 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  29.28 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1000  exsB protein  33.04 
 
 		 464 aa  122  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  30.49 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  34.48 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  31.06 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  29.69 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  30.9 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  32.31 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  30.7 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  29.2 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  35.24 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  29.2 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  29.46 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  30.14 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  27.23 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  32.76 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  28.51 
 
 		 221 aa  118  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  36.24 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  34.33 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1261  exsB protein  30.6 
 
 		 502 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  31.51 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  34.19 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  31.05 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  33.33 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  28.57 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  29.87 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  33.19 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  32.9 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  34.36 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  33.48 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  33.33 
 
 		 224 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  33.19 
 
 		 236 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  33.33 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  30 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  33.33 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  33.33 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  32.91 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  29.65 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  33.33 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  35.04 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  32.62 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  30.67 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>