292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0861 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  100 
 
 
220 aa  453  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  62.8 
 
 
223 aa  262  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  56.31 
 
 
220 aa  237  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  50.48 
 
 
233 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  50.96 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  50.96 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  44.23 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  48.82 
 
 
233 aa  194  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  50.72 
 
 
236 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  45.15 
 
 
218 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  48.56 
 
 
232 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  49.76 
 
 
236 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  48.56 
 
 
232 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  48.82 
 
 
236 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  45.63 
 
 
221 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  43.96 
 
 
221 aa  188  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  46.6 
 
 
217 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  43.2 
 
 
218 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  48.08 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  43.69 
 
 
219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  42.23 
 
 
218 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  46.38 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  43.75 
 
 
251 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  45.24 
 
 
243 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  37.5 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  37.61 
 
 
259 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  40.67 
 
 
222 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  37.61 
 
 
285 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  38.25 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  41.74 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  36.11 
 
 
229 aa  132  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  36.45 
 
 
484 aa  132  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  36.84 
 
 
222 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  39.35 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  41.12 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  40.48 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  37.32 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  36.79 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  31.48 
 
 
231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  38.25 
 
 
225 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  33.78 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  37.85 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  39.72 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  38.64 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  35.78 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  40.47 
 
 
224 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  38.79 
 
 
229 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  38.79 
 
 
227 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0028  exsB protein  38.83 
 
 
216 aa  126  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  34.86 
 
 
251 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  39.72 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  36.74 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  35.68 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  40 
 
 
229 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  40 
 
 
229 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  38.25 
 
 
226 aa  125  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  36.2 
 
 
246 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  38.07 
 
 
244 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  42.86 
 
 
227 aa  125  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  38.64 
 
 
235 aa  124  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  35.16 
 
 
271 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  37.96 
 
 
223 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  36.92 
 
 
222 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  37.79 
 
 
244 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  35.48 
 
 
237 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  36.41 
 
 
235 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 
230 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  38.6 
 
 
237 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  38.79 
 
 
230 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  40.09 
 
 
227 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  37.85 
 
 
224 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  32.88 
 
 
234 aa  121  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  33.03 
 
 
229 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  38.43 
 
 
230 aa  121  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  29.77 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  36.45 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  32.43 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  37.38 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  37.85 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  38.89 
 
 
227 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  37.85 
 
 
257 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  37.67 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  35.35 
 
 
233 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  36.07 
 
 
234 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  34.13 
 
 
229 aa  118  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  31.08 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  31.53 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  34.6 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  38.01 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  37.21 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  37.02 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  36.87 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  34.88 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  37.38 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  34.88 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  35.35 
 
 
228 aa  115  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  32.86 
 
 
218 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  35.78 
 
 
234 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  36.7 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  36.92 
 
 
224 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>