More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0729 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  97.42 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  95.28 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  78.11 
 
 		 233 aa  384  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  61.11 
 
 		 234 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  41.2 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  37.34 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0591  exsB protein  38.57 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1755  exsB protein  38.46 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1236  exsB protein  39.21 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  38.36 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  35.47 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  38.3 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  37.87 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  35.59 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  35.19 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  35.34 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  33.19 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  36.71 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  36.75 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  36.75 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  33.62 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  36.29 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  33.05 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  34.48 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  34.75 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  34.62 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  32.34 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  35.34 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  34.89 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  32.17 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  34.75 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  34.32 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  34.33 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  33.76 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1261  exsB protein  32.9 
 
 		 502 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  34.32 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  34.32 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  34.76 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  34.32 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  32.2 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  34.87 
 
 		 256 aa  128  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  33.61 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  33.9 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  31.65 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  35.47 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  32.62 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  33.9 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  33.9 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  31.03 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0547  exsB protein  33.76 
 
 		 469 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  31.78 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  32.62 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  31.78 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1000  exsB protein  33.76 
 
 		 464 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  33.9 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  34.32 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  35.17 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  33.05 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  35.19 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  31.78 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  32.33 
 
 		 222 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  32.48 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  33.33 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  33.47 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  31.91 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  32.91 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  30.64 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  30.21 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  33.9 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  31.03 
 
 		 258 aa  122  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  32.19 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  32.62 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  31.33 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  29.74 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  31.62 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  32.33 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  33.19 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  31.06 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 285 aa  119  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  31 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  31.62 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  31.62 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  35.47 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  30.77 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  33.9 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  33.48 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  32.44 
 
 		 484 aa  117  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  31.08 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  33.91 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  30.34 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  30.34 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  30.17 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  32.29 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  32.05 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  31.44 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  32.77 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  34.19 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>