More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0106 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  100 
 
 
221 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  66.51 
 
 
218 aa  325  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  68.35 
 
 
218 aa  323  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  64.22 
 
 
219 aa  313  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  65.75 
 
 
221 aa  312  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  64.22 
 
 
218 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  62.62 
 
 
219 aa  296  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  61.29 
 
 
251 aa  282  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  52.58 
 
 
221 aa  246  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  47.42 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  49.31 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  47.47 
 
 
233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  48.39 
 
 
232 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  48.39 
 
 
232 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  47.93 
 
 
235 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  48.86 
 
 
236 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  45.83 
 
 
233 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  47.93 
 
 
236 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  47.47 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  45.62 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  47.53 
 
 
237 aa  192  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  46.33 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  45.75 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  40.81 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  46.38 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  43.72 
 
 
225 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  43.29 
 
 
225 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  44.55 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  42.98 
 
 
230 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  42.86 
 
 
220 aa  169  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  43.86 
 
 
229 aa  168  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  42.92 
 
 
226 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  42.61 
 
 
237 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  41.33 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  42.99 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  44 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  41.33 
 
 
230 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  40.97 
 
 
226 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  41.23 
 
 
228 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  40.09 
 
 
224 aa  162  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  42.73 
 
 
228 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  40.91 
 
 
227 aa  161  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  42.53 
 
 
230 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  37.83 
 
 
244 aa  161  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  42.29 
 
 
224 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  40.71 
 
 
224 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  41.15 
 
 
237 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  42.99 
 
 
229 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  42.08 
 
 
224 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  42.53 
 
 
224 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  41.07 
 
 
241 aa  158  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  39.91 
 
 
228 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  41.67 
 
 
240 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  40.54 
 
 
222 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  39.91 
 
 
228 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  40.81 
 
 
223 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  39.82 
 
 
224 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  40.99 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  41.63 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  39.82 
 
 
224 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  41.63 
 
 
224 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  39.21 
 
 
246 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  41.18 
 
 
224 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  39.22 
 
 
256 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  38.81 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  40.54 
 
 
227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  40.62 
 
 
224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  40 
 
 
229 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  40.09 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  39.73 
 
 
221 aa  150  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  39.82 
 
 
224 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  40.61 
 
 
229 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  40.37 
 
 
222 aa  149  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  40.09 
 
 
227 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  39.91 
 
 
225 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  40.37 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  40.09 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  40.09 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  39.38 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  37.32 
 
 
484 aa  146  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  39.27 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  36.86 
 
 
285 aa  145  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  36.86 
 
 
259 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  39.45 
 
 
222 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  40.44 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  38.91 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  40.44 
 
 
234 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  39.38 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  37.17 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  37.96 
 
 
220 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  40.64 
 
 
243 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  37.22 
 
 
223 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  40 
 
 
234 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  38.18 
 
 
229 aa  142  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  42.08 
 
 
236 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  38.74 
 
 
230 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  38.94 
 
 
228 aa  141  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  40.27 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  39.91 
 
 
224 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  37.27 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>