More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0284 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  63.93 
 
 		 222 aa  299  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  61.82 
 
 		 222 aa  291  5e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  64.09 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  53.18 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  51.36 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  52.05 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  52.94 
 
 		 271 aa  240  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  49.09 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  47.49 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  49.09 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  47.51 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  50.44 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  47.49 
 
 		 258 aa  210  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  47.51 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  46.36 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  46.19 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  47.51 
 
 		 223 aa  204  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  48.65 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  43.18 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  48.02 
 
 		 224 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  48.17 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  44.5 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  47.51 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  45.61 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  47.2 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  44.14 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  47.56 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  46.19 
 
 		 222 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  44.09 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  44.14 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  46.73 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  46.22 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  47.39 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  45.13 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  46.78 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  43.95 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  44.86 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  43.58 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  45.25 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  45.65 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  46.7 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  47.89 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  45.09 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  44.93 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  42.33 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  42.33 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  45.58 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  46.23 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  46.67 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  45.09 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  45.37 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  45.13 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  44.16 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  44.64 
 
 		 230 aa  178  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  45.37 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  46.46 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  45.78 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  43.36 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  44.69 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  45.78 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  43.3 
 
 		 235 aa  174  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  42.04 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  44.54 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  45.85 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  44.89 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  42.22 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  43.05 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  42.22 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  42.6 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  45.78 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  43.17 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  44.69 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  41.41 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  45.18 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  44 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  44 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  45.85 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  42.92 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  42.73 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  44.44 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  45.41 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  39.29 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  44.07 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  43.75 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  42.04 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  41.67 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  42.11 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  41.7 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  45.54 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  44.93 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  44.93 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  41.74 
 
 		 246 aa  167  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  41.78 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  41.67 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  41.74 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  42.11 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  42.54 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>