298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0838 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  100 
 
 		 258 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  84.44 
 
 		 226 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  80.89 
 
 		 227 aa  390  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  79.11 
 
 		 226 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  78.22 
 
 		 226 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  77.33 
 
 		 226 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  76.85 
 
 		 218 aa  360  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  49.35 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  48.5 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  54.02 
 
 		 257 aa  241  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  49.78 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  50.43 
 
 		 271 aa  235  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  49.54 
 
 		 223 aa  234  9e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  49.08 
 
 		 220 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  46.12 
 
 		 221 aa  221  7e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  44.95 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  45.21 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  47.49 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  45 
 
 		 223 aa  208  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  45.58 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  43.84 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  43.12 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  44.8 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  44.34 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  44.34 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  49.34 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  47.62 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  44.05 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  45.25 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  43.56 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  43.72 
 
 		 241 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  42.92 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  44.2 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  42.67 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  46.22 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  42.29 
 
 		 224 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  42.04 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  41.56 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  43.75 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  44.78 
 
 		 226 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  44.65 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  44.3 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  42.92 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  44.3 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  41.59 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  40.34 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  42.48 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  44.89 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  44.14 
 
 		 222 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  44.2 
 
 		 223 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  41.48 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  42.11 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  42.04 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  41.48 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  42.41 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  43.61 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  44.44 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  41.05 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  42.41 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  43.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  43.17 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  41.59 
 
 		 224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  41.59 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  40.89 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  42.99 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  43.52 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  41.59 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  41.7 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  41.35 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  43.3 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  42.86 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  41.15 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  40.27 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  40.97 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  42.04 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  41.78 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  41.15 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  37.5 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  42.48 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  41.33 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  39.13 
 
 		 235 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  41.15 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  43.33 
 
 		 231 aa  158  9e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  38.18 
 
 		 484 aa  158  9e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  40.89 
 
 		 234 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  39.91 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  41.33 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  40.89 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  39.74 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  41.15 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  40.43 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  40.09 
 
 		 232 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  40.74 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  38.46 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  39.13 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  40.76 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  41.05 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  36.28 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>