296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4042 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4042  ExsB  100 
 
 
225 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  74.44 
 
 
229 aa  340  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  69.64 
 
 
224 aa  334  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  68.75 
 
 
226 aa  334  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  70.98 
 
 
232 aa  332  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  68.16 
 
 
224 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  68.16 
 
 
224 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  73.3 
 
 
233 aa  328  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  70.4 
 
 
232 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  71.49 
 
 
229 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  70.14 
 
 
226 aa  327  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  67.86 
 
 
227 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  70.54 
 
 
223 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  70.72 
 
 
224 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  69.68 
 
 
230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  70.72 
 
 
224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  68.78 
 
 
228 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  70.14 
 
 
224 aa  317  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  68.33 
 
 
224 aa  314  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  68.33 
 
 
224 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  68.33 
 
 
224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  73.99 
 
 
224 aa  309  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  67.86 
 
 
237 aa  307  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  64.13 
 
 
228 aa  305  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  68.61 
 
 
229 aa  305  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  67.86 
 
 
237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  63.68 
 
 
228 aa  302  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  65.62 
 
 
225 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  65.62 
 
 
225 aa  300  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  65.61 
 
 
225 aa  300  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  69.68 
 
 
224 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  60.81 
 
 
226 aa  299  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  60.36 
 
 
244 aa  297  8e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  66.96 
 
 
228 aa  297  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  66.36 
 
 
224 aa  297  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  66.37 
 
 
227 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  66.22 
 
 
230 aa  294  9e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  63.11 
 
 
246 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  66.37 
 
 
223 aa  292  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  63.84 
 
 
226 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  65.77 
 
 
230 aa  292  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  65.77 
 
 
221 aa  292  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  63.18 
 
 
229 aa  288  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  63.18 
 
 
229 aa  288  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  63.6 
 
 
229 aa  284  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  62.95 
 
 
230 aa  284  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  67.57 
 
 
224 aa  284  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  62.67 
 
 
234 aa  280  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  62.11 
 
 
241 aa  279  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  61.71 
 
 
244 aa  279  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  63.56 
 
 
233 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  62.33 
 
 
228 aa  274  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  59.82 
 
 
228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  60.63 
 
 
230 aa  272  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  59.91 
 
 
235 aa  271  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  63.59 
 
 
236 aa  271  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  63.11 
 
 
234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  63.11 
 
 
234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  58.37 
 
 
256 aa  269  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  63.11 
 
 
234 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  58.3 
 
 
259 aa  264  7e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  57.87 
 
 
285 aa  263  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  58.9 
 
 
233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  56.25 
 
 
227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  55.86 
 
 
222 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  54.91 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  56.7 
 
 
237 aa  241  7e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  53.6 
 
 
233 aa  238  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  55.14 
 
 
225 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  55.14 
 
 
225 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  54.75 
 
 
227 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  52.8 
 
 
230 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  50.67 
 
 
222 aa  234  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  52.63 
 
 
229 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  52.51 
 
 
226 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0300  exsB protein  60 
 
 
208 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.495784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  54.02 
 
 
227 aa  221  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  48.61 
 
 
229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  51.6 
 
 
226 aa  208  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  46.09 
 
 
229 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  52.31 
 
 
231 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  47.87 
 
 
224 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  45.58 
 
 
225 aa  201  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  47.83 
 
 
224 aa  201  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  47.39 
 
 
224 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  44.95 
 
 
225 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  47.91 
 
 
229 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  46.92 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  45.09 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  44.98 
 
 
222 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  44.64 
 
 
226 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  42.53 
 
 
484 aa  176  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  42.92 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  42.86 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  41.96 
 
 
243 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  42.41 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  40.69 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  40.89 
 
 
221 aa  170  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  46.9 
 
 
257 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  42.6 
 
 
224 aa  168  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>