More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0728 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  73.18 
 
 		 224 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  72.73 
 
 		 224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  72.73 
 
 		 224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  68.04 
 
 		 220 aa  308  5e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  65.91 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  63.64 
 
 		 223 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  60.45 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  61.36 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  44.55 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  43.12 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  43.58 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  45.25 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  42.66 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  42.66 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  43.12 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  44.09 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  41.28 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  39.73 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  46.88 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  42.2 
 
 		 226 aa  191  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  43.58 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  42.86 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  41.63 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  43.95 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  39.73 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  37.9 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  42.98 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  38.64 
 
 		 271 aa  171  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  42.86 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  39.73 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  43.36 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  43.36 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  36.07 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  38.43 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  39.64 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  43.42 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  38.22 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  43.42 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  39.74 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  37.04 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  37.5 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  39.29 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  40.27 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  36.07 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  37.95 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  36.16 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  37.5 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  38.5 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  36.49 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  37.5 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  36.04 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  39.45 
 
 		 484 aa  152  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  37.95 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  37.95 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  36.61 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  41.15 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  37.87 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 285 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  38.22 
 
 		 224 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  37.33 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  38.5 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  40 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  35.65 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  33.64 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  36.73 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  39.38 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  37.78 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  40.18 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  39.56 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  37.33 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  36.16 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  37.45 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  37.05 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  38.05 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  38.33 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  36.16 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  38.5 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  40.67 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  37.78 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  38.5 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  38.05 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  37.33 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  36.44 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  36.61 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  35.91 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  38.05 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  35.29 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  40.19 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  37.33 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  36.28 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  38.67 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  38.05 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  33.48 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  35.27 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  36.12 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0547  exsB protein  36.2 
 
 		 469 aa  139  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  37.73 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>