More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4398 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  100 
 
 		 230 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  88.79 
 
 		 224 aa  413  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  88.34 
 
 		 224 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  87.89 
 
 		 224 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  86.28 
 
 		 226 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  87.44 
 
 		 228 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  86.34 
 
 		 229 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  87.44 
 
 		 224 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  85.65 
 
 		 224 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  86.55 
 
 		 224 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  80.18 
 
 		 224 aa  357  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  69.55 
 
 		 223 aa  322  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  68 
 
 		 229 aa  321  7e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  69.68 
 
 		 225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  66.67 
 
 		 224 aa  318  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  65.32 
 
 		 224 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  66.22 
 
 		 225 aa  315  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  74.31 
 
 		 224 aa  314  8e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  64.86 
 
 		 224 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  67.73 
 
 		 229 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  67.57 
 
 		 232 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  66.82 
 
 		 221 aa  311  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  65.61 
 
 		 227 aa  311  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  64.25 
 
 		 228 aa  311  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  63.96 
 
 		 224 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  64.25 
 
 		 228 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 230 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  66.22 
 
 		 230 aa  308  5e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  63.35 
 
 		 226 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  64.13 
 
 		 227 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  69.23 
 
 		 224 aa  301  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  60.78 
 
 		 235 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  65.47 
 
 		 233 aa  295  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  65 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  58.67 
 
 		 244 aa  295  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  59.01 
 
 		 226 aa  295  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  64.57 
 
 		 226 aa  293  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  62.61 
 
 		 225 aa  291  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  62.16 
 
 		 225 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  65.02 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  64.86 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  60.62 
 
 		 229 aa  288  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  60.62 
 
 		 229 aa  288  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  63.51 
 
 		 223 aa  288  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  60.81 
 
 		 244 aa  287  9e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  63.96 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  61.61 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  62.16 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  58.26 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  59.21 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  61.71 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  58.44 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  57.52 
 
 		 234 aa  261  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  58.44 
 
 		 234 aa  261  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  58.01 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  55.93 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  57.59 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  55.07 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  58.18 
 
 		 236 aa  258  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  54.36 
 
 		 259 aa  254  6e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 285 aa  253  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  57.78 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  54.46 
 
 		 224 aa  248  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  55.66 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  56.05 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  54.26 
 
 		 222 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  53.88 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  53.81 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  53.85 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  54.22 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  50.68 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  51.1 
 
 		 229 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  52.07 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  50.93 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  53.18 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  50.46 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0300  exsB protein  58.33 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.495784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  47.22 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  47.53 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  46.4 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  45.37 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  50.91 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  47.14 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  45.12 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  48.65 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  45.37 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  43.38 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  49.31 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  46.88 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  42.86 
 
 		 484 aa  185  6e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  44.39 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  42.04 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  43.05 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  40.95 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  44.54 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  43.05 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  43.5 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  40.34 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  42.41 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  43.05 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>