299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1310 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1310  exsB protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  56.31 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  52.56 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  47.71 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  43.26 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  47.71 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  49.08 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  48.86 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  50 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  43.26 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  48.17 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  45.16 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  48.61 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  47.71 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  42.06 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  44.04 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  43.32 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  41.74 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  41.01 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  42.86 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  42.99 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  38.07 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  40.83 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  39.63 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0028  exsB protein  41.23 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  38.18 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  39.27 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  37.27 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  38.12 
 
 		 224 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 285 aa  135  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  36.53 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  40.53 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  35.56 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  35.43 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  36.44 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  34.75 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  36.73 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  34.58 
 
 		 484 aa  128  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  33.03 
 
 		 233 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  34.55 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  36.77 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  34.1 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  34.7 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  34.78 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  36.44 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  36.61 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  35.78 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  36.61 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  34.1 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  37.28 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  33.48 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  34.82 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  34.38 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  37.78 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  36.94 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  30.49 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  32.9 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  32.9 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  35.5 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  36.44 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  36.61 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  36.56 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  37.73 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  36.44 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  33.48 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  35.96 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  36.09 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  34.51 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  35.53 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  31.96 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  33.63 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  35.56 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  32.42 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  34.36 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  30.87 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  36.89 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  35.53 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  35.68 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  34.96 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  33.49 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  36.44 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  34.8 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  36.89 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  35.24 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  35.56 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  34.51 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0040  ExsB family protein  33.04 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  33.18 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  35.4 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  36 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  36 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  33.94 
 
 		 226 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  30.43 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  38.01 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  33.63 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  35.11 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  28.7 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  34.67 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  35.14 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  34.98 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>