296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  67.11 
 
 		 235 aa  288  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  41.67 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  36.68 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  40.35 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  38.14 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  37.17 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  38.7 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  39.06 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  36.36 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  38.89 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  35.71 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  39.06 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  37.99 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  41.74 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  39.21 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  37.93 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  37.77 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  37.83 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  37.66 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  38.84 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  35.9 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  38.1 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  37.45 
 
 		 484 aa  142  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  37.89 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  34.76 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  37.45 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  34.76 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  34.76 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  37.93 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  37.83 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  41.05 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  41.92 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  36.67 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  36.21 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  37.23 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  39.5 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  39.3 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  34.35 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  38.82 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  40.43 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  34.07 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  36.09 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  35.22 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  35.86 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  37.99 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  38.16 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  38.11 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  36.73 
 
 		 229 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  38.72 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  34.76 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  37.28 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  37.28 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  38.3 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  34.09 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  31.3 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  35.68 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  36.36 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0028  exsB protein  35.96 
 
 		 216 aa  129  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  32.2 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  37.72 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  37.55 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  33.18 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  37.87 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  35.09 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  35.42 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  33.19 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  32.89 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  36.6 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  36.33 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  33.03 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  34.86 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  36.75 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  37.66 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  36.75 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  36.32 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  34.48 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  32.31 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  36.32 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  36.18 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  38.46 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  36.17 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  34.21 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  37.61 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  36.05 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  34.4 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  37.19 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  35.94 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  37.08 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  39.74 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  37.61 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  36.48 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  36.32 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  35.78 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  37.08 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  35.9 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  34.45 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  34.33 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  37.02 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>