298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3719 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  82.76 
 
 		 232 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  82.33 
 
 		 232 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  83.19 
 
 		 232 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  79.15 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  77.02 
 
 		 236 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  76.6 
 
 		 236 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  73.68 
 
 		 233 aa  352  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  71.55 
 
 		 233 aa  349  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  73.25 
 
 		 232 aa  338  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  51.36 
 
 		 243 aa  222  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  47 
 
 		 218 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  46.54 
 
 		 218 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  47.93 
 
 		 221 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  43.78 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  50.96 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  43.32 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  42.92 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  41.01 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  45.09 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  48.61 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  43.58 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  46.79 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  41.47 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  40.08 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  38.74 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  42.41 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  41.07 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  40.74 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  42.04 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  38.6 
 
 		 224 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  41.4 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  39.07 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  39.73 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  39.11 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  38.67 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  38.67 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  39.73 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  39.29 
 
 		 224 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  40 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  39.56 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  40.93 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  39.29 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  38.84 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  39.73 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  39.29 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  40.97 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  41.26 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  39.56 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  39.57 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  39.56 
 
 		 230 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  38.81 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  38.57 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  39.07 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  37.44 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  38.36 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  38.26 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  41.7 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  37.33 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  36.89 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  38.67 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  37.5 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  38.12 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  37.67 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  38.77 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  37.93 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  38.16 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  37 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  37.33 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  37.17 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  38.84 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  37.72 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  37.61 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  38.39 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  40 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  41.05 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  37.85 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  36.97 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  37.22 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  37.22 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  38.01 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  38.57 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  38.68 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  38.57 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  37.78 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  36.49 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  37.89 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  37.17 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  38.5 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  34.38 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  37.39 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  35.4 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  35.56 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0028  exsB protein  37.26 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  39.57 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  38.05 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  38.86 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>