295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2420 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  51.5 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  51.58 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  50.91 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  50.22 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  51.83 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  50.23 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  50.45 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  50.45 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  51.61 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  51.15 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  43.12 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  44.44 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  42.79 
 
 		 219 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  46.33 
 
 		 221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  41.2 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  42.13 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  44.24 
 
 		 218 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  43.26 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  44.65 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  40 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  41.44 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  45.24 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  40.83 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  42.92 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  39.81 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  40.91 
 
 		 226 aa  158  9e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  37.1 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  38.43 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  37.61 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  40.09 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  37.93 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  35.59 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  36.11 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  37.16 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  38.25 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  38.71 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  37.04 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  36.52 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  38.33 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  39.21 
 
 		 240 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  37.84 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  40.81 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  37.73 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  40 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  41.85 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  36.44 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  39.73 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  37.05 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  33.64 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  33.94 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  39.45 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  33.64 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  34.74 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  36.57 
 
 		 226 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  36 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  40 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0040  ExsB family protein  34.96 
 
 		 224 aa  139  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  39.56 
 
 		 224 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  39.46 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  37.33 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  36.84 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  37.73 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  37.39 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  33.64 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  39.38 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  38.77 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  37.5 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  39.29 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  39.56 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  39.56 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  37.89 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  37.78 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  36.89 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  35.04 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  36.89 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  38.33 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  36.7 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  38.77 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  36.19 
 
 		 484 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  37.33 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  35.62 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  37.78 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  36.57 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  34.96 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  40.18 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  36.44 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  32.24 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  36.57 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  37.33 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  34.08 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  36.7 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  34.22 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  35.65 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  40.17 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  36.44 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  38.98 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  36.89 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  38.74 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>