296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0438 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  100 
 
 
224 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  39.91 
 
 
233 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  39.48 
 
 
233 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  37.34 
 
 
233 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  36.6 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  39.56 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  38.43 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0547  exsB protein  43.5 
 
 
469 aa  161  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  41.33 
 
 
257 aa  161  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  36.73 
 
 
220 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  40.97 
 
 
227 aa  158  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  43.11 
 
 
233 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  38.12 
 
 
243 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  42.22 
 
 
229 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  37.33 
 
 
251 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  41.59 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  34.67 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  35.87 
 
 
224 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1000  exsB protein  40.09 
 
 
464 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  41.78 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  34.53 
 
 
221 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  37.72 
 
 
222 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  39.74 
 
 
225 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  36.84 
 
 
229 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  41.33 
 
 
234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  37.44 
 
 
221 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  36.89 
 
 
223 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  36.89 
 
 
226 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  41.78 
 
 
229 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  39.47 
 
 
228 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  41.78 
 
 
229 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  40.89 
 
 
234 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  34.76 
 
 
233 aa  148  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  37.27 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  39.74 
 
 
228 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  37.78 
 
 
233 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1261  exsB protein  38.74 
 
 
502 aa  145  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 
230 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  38.36 
 
 
230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  40.53 
 
 
227 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  33.48 
 
 
258 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  37.39 
 
 
244 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  37.44 
 
 
226 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  36.99 
 
 
225 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  39.29 
 
 
229 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  36.44 
 
 
226 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  39.11 
 
 
235 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  38.05 
 
 
234 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  40 
 
 
229 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  34.96 
 
 
224 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  39.04 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  34.38 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  39.04 
 
 
223 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  37.22 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  36.07 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  36.49 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  33.48 
 
 
229 aa  138  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  33.93 
 
 
226 aa  138  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  39.01 
 
 
237 aa  138  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  39.11 
 
 
226 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  34.22 
 
 
224 aa  138  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  36.36 
 
 
232 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  34.22 
 
 
224 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  37.17 
 
 
227 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  37.17 
 
 
224 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  36.73 
 
 
241 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  33.95 
 
 
218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  39.65 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  36.73 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  36.11 
 
 
484 aa  135  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  36.44 
 
 
230 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  38.6 
 
 
224 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  36.96 
 
 
233 aa  134  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  39.11 
 
 
230 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  38.22 
 
 
224 aa  134  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  35.53 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  40.09 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  36.44 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  38.05 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  35.09 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  36.89 
 
 
228 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  33.78 
 
 
220 aa  132  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  32.14 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  34.5 
 
 
229 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  38.74 
 
 
236 aa  131  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  34.36 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  37.89 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  37.61 
 
 
237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  35.87 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  36.12 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  37.78 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  36.12 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  37.44 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  38.22 
 
 
228 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  36.73 
 
 
232 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  36.04 
 
 
227 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  35.96 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  36.09 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>