More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1000 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1000  exsB protein  100 
 
 
464 aa  948    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0547  exsB protein  72.73 
 
 
469 aa  719    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1261  exsB protein  58.94 
 
 
502 aa  570  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  40.09 
 
 
224 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  36.36 
 
 
223 aa  150  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  34.09 
 
 
220 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  36.82 
 
 
220 aa  141  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  33.03 
 
 
222 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  33.33 
 
 
484 aa  137  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  32.13 
 
 
227 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  33.48 
 
 
221 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  34.68 
 
 
226 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  32.74 
 
 
258 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  35.45 
 
 
221 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  33.18 
 
 
224 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  33.48 
 
 
226 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  31.98 
 
 
251 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  38.05 
 
 
222 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  34.98 
 
 
224 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  31.08 
 
 
221 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  33.18 
 
 
224 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  36.32 
 
 
233 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  33.18 
 
 
224 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  35.22 
 
 
257 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  33.76 
 
 
233 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  34.55 
 
 
223 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  33.33 
 
 
226 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  30.7 
 
 
243 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  32.43 
 
 
271 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  30.53 
 
 
233 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  31.22 
 
 
226 aa  123  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  34.19 
 
 
233 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  34.22 
 
 
237 aa  123  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  34.38 
 
 
233 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  33.04 
 
 
231 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  31.67 
 
 
229 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  32.29 
 
 
224 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  32.73 
 
 
222 aa  121  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  32.91 
 
 
233 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  33.48 
 
 
234 aa  120  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  32.74 
 
 
229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  33.62 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  31.67 
 
 
222 aa  116  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  31.6 
 
 
218 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  32.42 
 
 
224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  30.77 
 
 
233 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  31.51 
 
 
224 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  31.25 
 
 
225 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  31.05 
 
 
224 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  31.84 
 
 
227 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  29.55 
 
 
217 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  30.63 
 
 
221 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  31.08 
 
 
225 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1755  exsB protein  31.84 
 
 
228 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0591  exsB protein  30.81 
 
 
219 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  30.59 
 
 
224 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  33.19 
 
 
232 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  32.3 
 
 
236 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  31.08 
 
 
225 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  32.44 
 
 
227 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  32.47 
 
 
241 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  31.74 
 
 
229 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  32.74 
 
 
235 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  33.9 
 
 
234 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  32.16 
 
 
236 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  31.11 
 
 
218 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  32.6 
 
 
236 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  30.93 
 
 
227 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  30.45 
 
 
219 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  32.6 
 
 
232 aa  103  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  31.17 
 
 
229 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  31.17 
 
 
229 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  29.78 
 
 
226 aa  103  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  31.78 
 
 
244 aa  103  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  30.18 
 
 
229 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  32.6 
 
 
232 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  31.7 
 
 
226 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  31.88 
 
 
230 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  29.91 
 
 
233 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  30.53 
 
 
226 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  30.74 
 
 
232 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  31.78 
 
 
230 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  30.53 
 
 
232 aa  101  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  29.49 
 
 
234 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  30.53 
 
 
228 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  30.22 
 
 
233 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  31.51 
 
 
220 aa  100  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  30.36 
 
 
229 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  30.21 
 
 
230 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  30.34 
 
 
228 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  30.8 
 
 
218 aa  100  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  32.6 
 
 
224 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  29.54 
 
 
234 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  30.73 
 
 
225 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  29.15 
 
 
219 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  32.31 
 
 
224 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  29.91 
 
 
218 aa  98.2  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  31.42 
 
 
228 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  28.96 
 
 
225 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  29.49 
 
 
231 aa  97.8  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>