More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1261 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1261  exsB protein  100 
 
 		 502 aa  1026    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1000  exsB protein  58.94 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0547  exsB protein  57.66 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  38.74 
 
 		 224 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  34.25 
 
 		 220 aa  141  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  32.73 
 
 		 223 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  35.16 
 
 		 220 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  33.18 
 
 		 221 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  35.78 
 
 		 233 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  31.25 
 
 		 227 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  32.14 
 
 		 226 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  34.47 
 
 		 237 aa  133  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  34.67 
 
 		 224 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  34.65 
 
 		 251 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  31.74 
 
 		 258 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  32.89 
 
 		 222 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  33.04 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  32.14 
 
 		 226 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  32.9 
 
 		 233 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  33.77 
 
 		 233 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  34.23 
 
 		 222 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  31.62 
 
 		 243 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  33.18 
 
 		 221 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  35.22 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  31.7 
 
 		 226 aa  127  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  32.73 
 
 		 484 aa  127  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  31.82 
 
 		 221 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  34.23 
 
 		 221 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  31.11 
 
 		 229 aa  123  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  30.84 
 
 		 218 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  35.56 
 
 		 222 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  29.02 
 
 		 226 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  30.45 
 
 		 224 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  35.27 
 
 		 227 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  30.8 
 
 		 234 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  30.94 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  30.94 
 
 		 224 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  30.6 
 
 		 231 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  32.46 
 
 		 229 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  30.8 
 
 		 233 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  33.05 
 
 		 233 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  30 
 
 		 223 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  30.08 
 
 		 233 aa  114  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  31.82 
 
 		 224 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  32.43 
 
 		 218 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  31.05 
 
 		 224 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  31.53 
 
 		 233 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  32.49 
 
 		 228 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  32.13 
 
 		 219 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  32.77 
 
 		 232 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  30.14 
 
 		 224 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  33.04 
 
 		 241 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  29.79 
 
 		 259 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0591  exsB protein  31.4 
 
 		 219 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  32.47 
 
 		 234 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 285 aa  107  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  33.9 
 
 		 237 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  32.39 
 
 		 225 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  30.49 
 
 		 221 aa  106  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  32.62 
 
 		 234 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  29.86 
 
 		 219 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  32.39 
 
 		 225 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  33.05 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  34.35 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  31.12 
 
 		 232 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  30.49 
 
 		 224 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  31.14 
 
 		 232 aa  104  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  32.19 
 
 		 234 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  31.7 
 
 		 225 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  32.77 
 
 		 233 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  33.62 
 
 		 227 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  30.71 
 
 		 232 aa  103  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  32.16 
 
 		 230 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  31 
 
 		 229 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  32.77 
 
 		 235 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  33.48 
 
 		 225 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  31 
 
 		 229 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  33.48 
 
 		 225 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  31.47 
 
 		 230 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  30.49 
 
 		 229 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  33.8 
 
 		 231 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  33.04 
 
 		 233 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  29.46 
 
 		 217 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  31.86 
 
 		 228 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  32 
 
 		 223 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  30.91 
 
 		 226 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  32.74 
 
 		 226 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  33.33 
 
 		 236 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  33.78 
 
 		 237 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  30.84 
 
 		 224 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  29.36 
 
 		 224 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  31.3 
 
 		 228 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  30.4 
 
 		 224 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  30.4 
 
 		 224 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  32.14 
 
 		 218 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  30.41 
 
 		 230 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  30.09 
 
 		 227 aa  98.2  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  30.17 
 
 		 226 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  33.76 
 
 		 236 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>