275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1755 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1755  exsB protein  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0591  exsB protein  56.07 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1236  exsB protein  56.22 
 
 		 220 aa  225  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  44.64 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  46.88 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  40.6 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  39.32 
 
 		 233 aa  174  7e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  38.46 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  38.89 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  35.9 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  38.36 
 
 		 484 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  32.75 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  32.17 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  33.48 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  32.89 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  34.36 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  33.48 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  31.67 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  30.97 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  32.42 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  31.28 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  31.28 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  31.67 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  30.74 
 
 		 224 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  31.08 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1000  exsB protein  31.84 
 
 		 464 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  32.11 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  30.4 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  31.28 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  32.88 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  33.62 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  30.36 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  33.62 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  33.48 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  29.91 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0547  exsB protein  32.14 
 
 		 469 aa  108  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  27.68 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  29.68 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  29.96 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  31.25 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  32.48 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  29.05 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  30.63 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  29.52 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  30.19 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  31.76 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  30.3 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  33.77 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  33.77 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  30.18 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  32.3 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  27.93 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  32.19 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  30.67 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  28.63 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  29.44 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  30 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  33.63 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  30.7 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  31.86 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  27.35 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  30.9 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  28.45 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  30.3 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  29.58 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  31.47 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  31.9 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  31.47 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  29.91 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  27.27 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  27.16 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  29.87 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  29.87 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  31.03 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  30.47 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  28.57 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  26.98 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  31.47 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  28.7 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  30.47 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  31.58 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  26.27 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  28.5 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  30.87 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  31.53 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  30.83 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1261  exsB protein  29.15 
 
 		 502 aa  95.1  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  28.64 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  30.94 
 
 		 232 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  29.66 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  26.58 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  31.6 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  32.13 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  27.47 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  33.33 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  29.66 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  32.13 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  31.44 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  30.6 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  28.77 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>