65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0539 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  312  8e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  63.24 
 
 		 676 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  63.24 
 
 		 676 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  55.07 
 
 		 673 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0772  hypothetical protein  100 
 
 		 44 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  63.64 
 
 		 680 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  60 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  56.92 
 
 		 709 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  59.68 
 
 		 676 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  62.75 
 
 		 583 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  65.38 
 
 		 607 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  68.75 
 
 		 728 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  66.67 
 
 		 675 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  46.34 
 
 		 569 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  64.71 
 
 		 661 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  64.71 
 
 		 661 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  34.82 
 
 		 683 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  66.67 
 
 		 725 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  53.85 
 
 		 661 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  57.89 
 
 		 659 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  61.54 
 
 		 611 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  46.48 
 
 		 587 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  59.62 
 
 		 777 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  46.67 
 
 		 806 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  63.46 
 
 		 580 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  55 
 
 		 636 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  44 
 
 		 655 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  67.44 
 
 		 663 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  54 
 
 		 708 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  49.33 
 
 		 783 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  52 
 
 		 658 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  46.48 
 
 		 592 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  51.85 
 
 		 589 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  71.43 
 
 		 670 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  50 
 
 		 356 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  46.15 
 
 		 673 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  50.88 
 
 		 608 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.61 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  45.16 
 
 		 686 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  55.56 
 
 		 787 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  55.56 
 
 		 829 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  60.42 
 
 		 677 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  55.56 
 
 		 793 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  53.7 
 
 		 794 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  41.07 
 
 		 661 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  50.85 
 
 		 710 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  48.53 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  58.18 
 
 		 793 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  50.88 
 
 		 778 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  45 
 
 		 725 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  52.54 
 
 		 790 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.17 
 
 		 644 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1225  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  47.69 
 
 		 799 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  46.97 
 
 		 647 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  38.24 
 
 		 675 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  59.52 
 
 		 763 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  43.4 
 
 		 691 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  37.29 
 
 		 675 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  43.9 
 
 		 659 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 587 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  35.56 
 
 		 574 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  32.31 
 
 		 511 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  35.56 
 
 		 574 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  35.56 
 
 		 574 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>