55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1225 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1225  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  77.59 
 
 
710 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  67.69 
 
 
677 aa  94  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  75 
 
 
196 aa  92  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  74.14 
 
 
778 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  58.44 
 
 
829 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  65.67 
 
 
783 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  68.85 
 
 
636 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  72.73 
 
 
793 aa  90.5  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  70.91 
 
 
794 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  70.91 
 
 
787 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  66.04 
 
 
725 aa  85.5  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  75 
 
 
608 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  70.18 
 
 
793 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  70.18 
 
 
790 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  81.82 
 
 
647 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  54.24 
 
 
676 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  54.24 
 
 
676 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  54.55 
 
 
680 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  48.44 
 
 
709 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  46.88 
 
 
686 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0539  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  50 
 
 
586 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  78.79 
 
 
763 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  50 
 
 
607 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  58.33 
 
 
580 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  45.45 
 
 
708 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  48.08 
 
 
806 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  51.06 
 
 
569 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  50.91 
 
 
673 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  54.9 
 
 
663 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.09 
 
 
676 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  44.93 
 
 
725 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  54.17 
 
 
675 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  46 
 
 
777 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  44.93 
 
 
728 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  48.21 
 
 
661 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  43.64 
 
 
659 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  43.64 
 
 
661 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  53.19 
 
 
316 aa  47.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  38.18 
 
 
658 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  54.55 
 
 
611 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  43.86 
 
 
670 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  51.11 
 
 
673 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  40.38 
 
 
655 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  41.94 
 
 
583 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  38.18 
 
 
661 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  47.27 
 
 
356 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  39.06 
 
 
683 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.82 
 
 
644 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  45.61 
 
 
592 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  51.06 
 
 
587 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  41.38 
 
 
589 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0772  hypothetical protein  51.35 
 
 
44 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  42.59 
 
 
691 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>