More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1220 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1220  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
322 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  63.16 
 
 
320 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  57.76 
 
 
319 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  57.01 
 
 
321 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  58.26 
 
 
319 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0312  family 9 glycosyl transferase  51.55 
 
 
319 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0618  glycosyl transferase family 9  54.21 
 
 
315 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0634  glycosyl transferase family 9  54.21 
 
 
315 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  29.26 
 
 
781 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
361 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.36 
 
 
359 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.58 
 
 
343 aa  92.8  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.9 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1743  hypothetical protein  30.81 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  24.12 
 
 
348 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.89 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.65 
 
 
352 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.99 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.99 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.99 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.99 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.99 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  27.99 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.99 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.48 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.12 
 
 
360 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.38 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.83 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.42 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.33 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.42 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.42 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.42 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  27.96 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.33 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.42 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  22.73 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.32 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.32 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.76 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.07 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.07 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.22 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.66 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.66 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.89 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.74 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.74 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  25.83 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.96 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.4 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  23.68 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.57 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.41 
 
 
516 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.25 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  21.09 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.93 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  20.48 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  24.69 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  26.51 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.28 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.36 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.92 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  23.47 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0619  hypothetical protein  25.27 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  22.92 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  26.57 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  25.17 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  25.08 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  26.91 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  26.22 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.57 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  27.85 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  23.32 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.65 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  23.85 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.87 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  20.78 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.57 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.52 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  21.59 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.87 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  22.02 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.87 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.71 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.44 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>