More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3725 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3725  Methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
311 aa  595  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.715086  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 
310 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.82 
 
 
318 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  38.66 
 
 
307 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 
314 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  39.62 
 
 
320 aa  178  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  38.8 
 
 
299 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  40.57 
 
 
306 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 
302 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 
314 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  40.43 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 
314 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.22 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.26 
 
 
310 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  39.56 
 
 
310 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 
302 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 
302 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 
310 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 
310 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  39.56 
 
 
297 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  38.73 
 
 
310 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 
319 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  35.96 
 
 
315 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  37.93 
 
 
308 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 
307 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  37.26 
 
 
310 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  35.96 
 
 
315 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  39.49 
 
 
312 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  34.08 
 
 
312 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  35.78 
 
 
315 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  35.33 
 
 
321 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 
357 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  42.54 
 
 
314 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  34.8 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  41.49 
 
 
311 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  35.35 
 
 
329 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  37.39 
 
 
331 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  35.85 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  35.87 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  40.95 
 
 
320 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  40.18 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  35.56 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  31.53 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  37.14 
 
 
306 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 
315 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  38.77 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  41.77 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  36.99 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  38.17 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  38.22 
 
 
310 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  36.86 
 
 
327 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  33.76 
 
 
314 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  33.76 
 
 
314 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 
323 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 
322 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 
314 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 
315 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 
324 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  39.88 
 
 
323 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  35.13 
 
 
312 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 
327 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1712  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 
318 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  39.88 
 
 
323 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  35.9 
 
 
314 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 
301 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  35.9 
 
 
314 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 
306 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 
309 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  36.81 
 
 
323 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 
313 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 
306 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 
313 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  36.81 
 
 
344 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  34.71 
 
 
318 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  34.71 
 
 
318 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 
328 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 
327 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  30.7 
 
 
313 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  40.31 
 
 
308 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 
312 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  38.99 
 
 
313 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
318 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
318 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 
327 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  35.99 
 
 
315 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  34.39 
 
 
318 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  30.38 
 
 
319 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 
310 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  35.99 
 
 
315 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>