62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3144 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3144  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 109 aa  211  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.371941  normal  0.32831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  34.78 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  31.4 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 170 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  20 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.94 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  37.1 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.38 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 269 aa  43.9  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  27.71 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 111 aa  43.5  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  32.05 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.27 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.76 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  26.67 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  30.34 
 
 		 111 aa  42  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  30.34 
 
 		 111 aa  42  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  32.14 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  31.46 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  31.65 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 145 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  26 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35.37 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  23.76 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  25.84 
 
 		 123 aa  40.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  22.99 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  29.82 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  32.1 
 
 		 540 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>