More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3135 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3135  CheW protein  100 
 
 
132 aa  244  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  38.83 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  30.95 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  38.93 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  29.37 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6784  CheW protein  35.88 
 
 
199 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  36.52 
 
 
165 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  31.5 
 
 
306 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  38.3 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  37.08 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  25.19 
 
 
365 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  33.86 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  31.91 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  25.76 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  24.81 
 
 
365 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  29.2 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.78 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  34.44 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  31.25 
 
 
167 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  41.57 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  41.3 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  27.42 
 
 
169 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.38 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  39.13 
 
 
165 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  30.77 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.91 
 
 
518 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  36.47 
 
 
165 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  37.65 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  35.56 
 
 
161 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.74 
 
 
168 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  26.05 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  31.25 
 
 
171 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  35.96 
 
 
141 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  32.94 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36.67 
 
 
159 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  30.71 
 
 
308 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  36.67 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  31.5 
 
 
308 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  34.34 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  30.3 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  40.45 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  40.45 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  28.23 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  30.23 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28.74 
 
 
444 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  32.58 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  27.96 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.87 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  35.96 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  29.93 
 
 
342 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.96 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  26.92 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.87 
 
 
174 aa  50.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.87 
 
 
164 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.41 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.41 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  24.6 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  30.77 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  35.87 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  33.33 
 
 
200 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  27.48 
 
 
306 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  27.48 
 
 
306 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  32.31 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  31 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  27.48 
 
 
306 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  27.48 
 
 
309 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  37.65 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.07 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  29.17 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  28.57 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  31.62 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  28.03 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.07 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35.16 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  28.69 
 
 
201 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.71 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  31.54 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.07 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.07 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.27 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  28.23 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  26.72 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.94 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  26.72 
 
 
306 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  26.72 
 
 
306 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.69 
 
 
163 aa  47.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.08 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  32.14 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  29.2 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  36.25 
 
 
320 aa  47.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  40.74 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  25 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  26.72 
 
 
306 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  26.72 
 
 
306 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.46 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  25.95 
 
 
306 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.14 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>