More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3350 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.82 
 
 		 1244 aa  1290    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.19 
 
 		 1254 aa  1277    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  49.96 
 
 		 1251 aa  1246    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  47.07 
 
 		 1241 aa  1157    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50 
 
 		 1252 aa  1226    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.09 
 
 		 1243 aa  1293    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.34 
 
 		 1256 aa  1464    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  51.9 
 
 		 1231 aa  1329    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.29 
 
 		 1631 aa  1025    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.72 
 
 		 1266 aa  1361    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.64 
 
 		 1266 aa  1359    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.63 
 
 		 1284 aa  1481    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.53 
 
 		 1251 aa  1306    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.38 
 
 		 1236 aa  1194    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.38 
 
 		 1238 aa  1313    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  45.6 
 
 		 1241 aa  1131    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.2 
 
 		 1256 aa  1499    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 1293 aa  2673    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.59 
 
 		 1244 aa  1311    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.95 
 
 		 962 aa  274  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.73 
 
 		 945 aa  272  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.59 
 
 		 947 aa  261  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.97 
 
 		 966 aa  251  9e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.61 
 
 		 981 aa  248  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.25 
 
 		 985 aa  246  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.59 
 
 		 973 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.43 
 
 		 953 aa  233  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.4 
 
 		 953 aa  231  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.53 
 
 		 982 aa  225  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.79 
 
 		 959 aa  223  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.63 
 
 		 953 aa  218  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.42 
 
 		 979 aa  218  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.66 
 
 		 766 aa  214  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.72 
 
 		 993 aa  212  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.95 
 
 		 979 aa  209  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.62 
 
 		 995 aa  206  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.54 
 
 		 996 aa  206  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.37 
 
 		 1004 aa  206  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.95 
 
 		 996 aa  205  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.1 
 
 		 993 aa  202  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.74 
 
 		 1004 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.03 
 
 		 996 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  24.28 
 
 		 996 aa  198  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.69 
 
 		 1007 aa  198  6e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.16 
 
 		 989 aa  197  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.63 
 
 		 1293 aa  194  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.78 
 
 		 989 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.05 
 
 		 989 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.7 
 
 		 993 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.15 
 
 		 1293 aa  192  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.15 
 
 		 1293 aa  192  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.64 
 
 		 1295 aa  192  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.38 
 
 		 1297 aa  190  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.15 
 
 		 1293 aa  190  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.07 
 
 		 1293 aa  190  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.24 
 
 		 1293 aa  188  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  25.38 
 
 		 1032 aa  186  3e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.91 
 
 		 1293 aa  186  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.09 
 
 		 1293 aa  186  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.21 
 
 		 1293 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.95 
 
 		 1293 aa  186  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.19 
 
 		 1293 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.96 
 
 		 1293 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.64 
 
 		 996 aa  185  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  23.55 
 
 		 1020 aa  184  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.65 
 
 		 1293 aa  183  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.94 
 
 		 1345 aa  183  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.05 
 
 		 1293 aa  182  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  24.78 
 
 		 996 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.13 
 
 		 996 aa  179  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.33 
 
 		 1298 aa  178  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.83 
 
 		 1297 aa  177  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.1 
 
 		 1221 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0543  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.15 
 
 		 1294 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164924  normal  0.914439 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.54 
 
 		 1345 aa  176  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.17 
 
 		 1234 aa  175  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3203  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.72 
 
 		 1311 aa  176  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0208  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.98 
 
 		 1345 aa  174  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.5 
 
 		 1293 aa  173  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.52 
 
 		 1293 aa  173  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.38 
 
 		 999 aa  172  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.85 
 
 		 739 aa  172  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0187  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.87 
 
 		 1342 aa  172  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0359438  normal  0.315795 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.5 
 
 		 1309 aa  171  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.27 
 
 		 768 aa  171  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.85 
 
 		 1223 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.17 
 
 		 800 aa  169  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.73 
 
 		 1217 aa  169  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.19 
 
 		 1292 aa  169  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.91 
 
 		 1299 aa  169  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41441  predicted protein  24.32 
 
 		 1348 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3318  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24 
 
 		 1297 aa  167  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.99 
 
 		 1297 aa  165  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.05 
 
 		 1299 aa  164  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.02 
 
 		 1414 aa  164  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.077761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.89 
 
 		 1299 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1037  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.37 
 
 		 1299 aa  163  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.57 
 
 		 946 aa  163  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2283  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  22.77 
 
 		 1361 aa  163  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.29 
 
 		 1344 aa  163  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>