More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0351 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.53 
 
 
1293 aa  1301    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  46.11 
 
 
1241 aa  1103    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.7 
 
 
1252 aa  1160    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.39 
 
 
1236 aa  1159    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.1 
 
 
1631 aa  1016    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.14 
 
 
1244 aa  1793    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.26 
 
 
1284 aa  1365    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55 
 
 
1256 aa  1396    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  49.64 
 
 
1244 aa  1203    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.92 
 
 
1266 aa  1277    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.13 
 
 
1266 aa  1274    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  70.05 
 
 
1238 aa  1790    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  46.1 
 
 
1241 aa  1093    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 
1251 aa  2572    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  63.67 
 
 
1251 aa  1645    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.77 
 
 
1243 aa  1714    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.01 
 
 
1254 aa  1743    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  59.14 
 
 
1231 aa  1470    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.9 
 
 
1256 aa  1396    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.93 
 
 
962 aa  297  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.42 
 
 
945 aa  295  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.71 
 
 
947 aa  275  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.07 
 
 
953 aa  258  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.69 
 
 
966 aa  255  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.04 
 
 
953 aa  249  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.14 
 
 
953 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.35 
 
 
959 aa  246  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.14 
 
 
985 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.16 
 
 
981 aa  242  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.07 
 
 
982 aa  241  9e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.67 
 
 
766 aa  234  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.47 
 
 
973 aa  233  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.85 
 
 
979 aa  231  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.34 
 
 
979 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.71 
 
 
989 aa  218  8e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.7 
 
 
989 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.52 
 
 
1297 aa  214  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.89 
 
 
1297 aa  213  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.84 
 
 
989 aa  213  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.15 
 
 
800 aa  212  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.75 
 
 
996 aa  211  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.08 
 
 
993 aa  204  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.05 
 
 
996 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.08 
 
 
1298 aa  203  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.57 
 
 
993 aa  201  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.12 
 
 
996 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.49 
 
 
1004 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.84 
 
 
1298 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  24.79 
 
 
996 aa  196  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.8 
 
 
1299 aa  196  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25 
 
 
995 aa  194  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.11 
 
 
996 aa  194  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.33 
 
 
1298 aa  193  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  25.82 
 
 
996 aa  193  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.94 
 
 
1299 aa  192  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.12 
 
 
1293 aa  191  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.51 
 
 
996 aa  191  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1037  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.8 
 
 
1299 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.23 
 
 
999 aa  189  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  24.62 
 
 
1020 aa  189  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.26 
 
 
1293 aa  189  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.46 
 
 
768 aa  188  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.7 
 
 
1293 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.06 
 
 
1299 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.31 
 
 
1341 aa  185  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15740  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.45 
 
 
1298 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.989806  hitchhiker  0.000000174992 
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.1 
 
 
1234 aa  184  9.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.92 
 
 
993 aa  184  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39660  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.78 
 
 
1298 aa  183  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.64 
 
 
1309 aa  182  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.17 
 
 
1297 aa  182  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  25.71 
 
 
1032 aa  181  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.29 
 
 
1007 aa  181  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.94 
 
 
993 aa  181  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.46 
 
 
1301 aa  181  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.42 
 
 
1222 aa  181  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.74 
 
 
1004 aa  181  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.08 
 
 
946 aa  180  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.49 
 
 
1217 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.3 
 
 
1299 aa  179  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.87 
 
 
1293 aa  179  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41441  predicted protein  24.93 
 
 
1348 aa  177  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.48 
 
 
1295 aa  177  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.69 
 
 
1221 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.37 
 
 
1298 aa  174  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.39 
 
 
1293 aa  173  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.85 
 
 
1293 aa  172  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.79 
 
 
1298 aa  171  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2196  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.43 
 
 
1299 aa  171  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0353893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.88 
 
 
1313 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.53 
 
 
1223 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.67 
 
 
1291 aa  167  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.72 
 
 
1298 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3623  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.35 
 
 
1296 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.34 
 
 
1214 aa  166  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.72 
 
 
1293 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3318  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.63 
 
 
1297 aa  167  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.98 
 
 
1296 aa  166  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1253  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.34 
 
 
1296 aa  165  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.34 
 
 
1296 aa  165  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>