More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0671 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.72 
 
 
1293 aa  1368    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.93 
 
 
1238 aa  1292    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  46.68 
 
 
1241 aa  1141    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.38 
 
 
1252 aa  1259    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.46 
 
 
1244 aa  1269    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.14 
 
 
1244 aa  1320    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.37 
 
 
1284 aa  1474    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.87 
 
 
1631 aa  1036    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.43 
 
 
1236 aa  1228    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.2 
 
 
1256 aa  1472    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.85 
 
 
1256 aa  1444    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  53.63 
 
 
1231 aa  1318    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.92 
 
 
1251 aa  1291    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 
1266 aa  2575    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  97.16 
 
 
1266 aa  2480    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.3 
 
 
1251 aa  1289    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  47.24 
 
 
1241 aa  1156    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.15 
 
 
1243 aa  1310    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.75 
 
 
1254 aa  1260    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.44 
 
 
962 aa  320  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.72 
 
 
945 aa  311  5.9999999999999995e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.64 
 
 
947 aa  300  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.44 
 
 
953 aa  293  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.05 
 
 
953 aa  290  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.84 
 
 
953 aa  283  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.75 
 
 
966 aa  277  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.62 
 
 
766 aa  271  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.05 
 
 
985 aa  268  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.77 
 
 
981 aa  263  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.17 
 
 
973 aa  263  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.3 
 
 
993 aa  258  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.08 
 
 
959 aa  257  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.72 
 
 
996 aa  250  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.36 
 
 
979 aa  249  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.48 
 
 
979 aa  247  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.73 
 
 
1004 aa  244  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.9 
 
 
982 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.92 
 
 
996 aa  241  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.09 
 
 
996 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  26.3 
 
 
996 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.71 
 
 
993 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.36 
 
 
993 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.2 
 
 
996 aa  235  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.49 
 
 
996 aa  235  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  27.57 
 
 
996 aa  230  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.69 
 
 
989 aa  222  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.89 
 
 
989 aa  219  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.42 
 
 
768 aa  220  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.84 
 
 
989 aa  218  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.18 
 
 
995 aa  218  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.83 
 
 
999 aa  212  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  24.71 
 
 
1020 aa  205  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  26.06 
 
 
1032 aa  202  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.02 
 
 
1297 aa  203  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.41 
 
 
993 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.17 
 
 
1004 aa  202  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.97 
 
 
1341 aa  201  7.999999999999999e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3113  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.23 
 
 
1295 aa  201  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.79 
 
 
1293 aa  200  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.8 
 
 
800 aa  199  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.22 
 
 
1007 aa  199  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.73 
 
 
1293 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.04 
 
 
946 aa  197  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.53 
 
 
1301 aa  197  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.04 
 
 
1293 aa  193  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.48 
 
 
1293 aa  193  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.96 
 
 
1293 aa  193  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.96 
 
 
1293 aa  192  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.04 
 
 
1293 aa  192  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.09 
 
 
1297 aa  191  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.96 
 
 
1293 aa  191  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.36 
 
 
1298 aa  191  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.11 
 
 
1293 aa  191  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0208  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.84 
 
 
1345 aa  190  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.02 
 
 
1293 aa  187  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75569  5'-phosphoribosylformyl glycinamidine synthetase  24.35 
 
 
1343 aa  187  8e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0273535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.3 
 
 
1291 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.02 
 
 
1293 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.75 
 
 
1295 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.05 
 
 
1293 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.6 
 
 
1234 aa  185  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1153  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.78 
 
 
1291 aa  184  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609825  hitchhiker  0.0000127323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.33 
 
 
1309 aa  183  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.79 
 
 
1293 aa  183  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.35 
 
 
1297 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.6 
 
 
1293 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.98 
 
 
1293 aa  182  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2420  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  21.72 
 
 
1409 aa  181  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.466313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23 
 
 
1313 aa  181  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.34 
 
 
1009 aa  179  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1761  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  21.46 
 
 
1336 aa  178  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.219026 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  21.92 
 
 
1283 aa  178  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1988  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  21.92 
 
 
1283 aa  178  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.37 
 
 
751 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.04 
 
 
1298 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1478  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.62 
 
 
1290 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.704135 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.41 
 
 
1222 aa  176  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17772  predicted protein  24.76 
 
 
1313 aa  175  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.99 
 
 
1293 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.54 
 
 
1217 aa  174  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>