More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0432 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  46.04 
 
 
996 aa  812    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.14 
 
 
995 aa  771    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.14 
 
 
996 aa  816    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  61.54 
 
 
998 aa  1222    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.18 
 
 
993 aa  759    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  45.25 
 
 
1020 aa  825    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.85 
 
 
996 aa  810    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.04 
 
 
996 aa  827    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.34 
 
 
993 aa  776    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.08 
 
 
1004 aa  759    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.34 
 
 
996 aa  819    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 
1009 aa  2063    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.99 
 
 
999 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.55 
 
 
996 aa  794    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  46.04 
 
 
996 aa  810    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.33 
 
 
993 aa  724    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.86 
 
 
989 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.86 
 
 
989 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.76 
 
 
989 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.69 
 
 
953 aa  602  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.69 
 
 
953 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.96 
 
 
979 aa  596  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.48 
 
 
953 aa  588  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.44 
 
 
993 aa  589  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.48 
 
 
979 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.5 
 
 
982 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.97 
 
 
1004 aa  531  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.22 
 
 
966 aa  511  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.68 
 
 
1007 aa  508  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  38.43 
 
 
1032 aa  501  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.45 
 
 
973 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.98 
 
 
959 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.05 
 
 
985 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.19 
 
 
947 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.88 
 
 
981 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.27 
 
 
962 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.92 
 
 
945 aa  469  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36 
 
 
800 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.62 
 
 
766 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.14 
 
 
946 aa  398  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.46 
 
 
768 aa  360  5e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.39 
 
 
767 aa  281  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.11 
 
 
733 aa  278  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.02 
 
 
733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.24 
 
 
759 aa  274  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.66 
 
 
758 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.64 
 
 
742 aa  267  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.36 
 
 
759 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.16 
 
 
740 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.4 
 
 
765 aa  262  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.83 
 
 
746 aa  261  6e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.58 
 
 
759 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.03 
 
 
781 aa  258  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.03 
 
 
758 aa  258  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  30.28 
 
 
727 aa  254  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.66 
 
 
758 aa  254  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.22 
 
 
751 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.25 
 
 
742 aa  253  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.32 
 
 
754 aa  253  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.65 
 
 
764 aa  253  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.22 
 
 
732 aa  252  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.95 
 
 
761 aa  250  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.63 
 
 
798 aa  248  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.84 
 
 
715 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.99 
 
 
741 aa  248  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.62 
 
 
739 aa  247  6.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.08 
 
 
807 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.81 
 
 
739 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.46 
 
 
737 aa  245  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.53 
 
 
764 aa  245  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.61 
 
 
769 aa  245  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.42 
 
 
733 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.82 
 
 
760 aa  244  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.95 
 
 
751 aa  244  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.37 
 
 
741 aa  244  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.32 
 
 
739 aa  244  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.32 
 
 
739 aa  244  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.92 
 
 
769 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.32 
 
 
739 aa  243  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.37 
 
 
768 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.18 
 
 
739 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4546  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.37 
 
 
768 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.37 
 
 
768 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.32 
 
 
739 aa  243  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.89 
 
 
765 aa  243  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.32 
 
 
739 aa  243  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.18 
 
 
739 aa  243  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.87 
 
 
761 aa  243  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.7 
 
 
760 aa  243  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.32 
 
 
739 aa  243  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.52 
 
 
761 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.32 
 
 
739 aa  241  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.52 
 
 
761 aa  241  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.18 
 
 
739 aa  240  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.38 
 
 
755 aa  240  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.15 
 
 
736 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.13 
 
 
772 aa  240  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.38 
 
 
739 aa  239  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.57 
 
 
745 aa  239  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.87 
 
 
754 aa  238  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>