More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1328 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.29 
 
 		 953 aa  778    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  68.57 
 
 		 996 aa  1395    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.69 
 
 		 959 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  45.66 
 
 		 1032 aa  686    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.97 
 
 		 996 aa  1352    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.72 
 
 		 993 aa  1143    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.3 
 
 		 979 aa  753    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.95 
 
 		 1004 aa  677    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.69 
 
 		 953 aa  757    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.21 
 
 		 989 aa  772    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.76 
 
 		 982 aa  720    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  100 
 
 		 1020 aa  2102    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.5 
 
 		 966 aa  718    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.77 
 
 		 996 aa  1392    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  59.32 
 
 		 993 aa  1154    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.09 
 
 		 953 aa  765    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.41 
 
 		 979 aa  741    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.42 
 
 		 1007 aa  668    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.11 
 
 		 981 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  66.67 
 
 		 996 aa  1346    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.16 
 
 		 996 aa  1333    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.77 
 
 		 996 aa  1346    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.85 
 
 		 999 aa  1043    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.76 
 
 		 985 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.37 
 
 		 998 aa  795    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.11 
 
 		 1004 aa  1112    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.11 
 
 		 989 aa  778    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.25 
 
 		 1009 aa  785    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.17 
 
 		 973 aa  666    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.16 
 
 		 996 aa  1343    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.21 
 
 		 989 aa  778    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  56.38 
 
 		 995 aa  1111    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.65 
 
 		 993 aa  736    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.31 
 
 		 993 aa  1125    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.54 
 
 		 945 aa  590  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.44 
 
 		 947 aa  575  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.8 
 
 		 962 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.45 
 
 		 766 aa  525  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.06 
 
 		 800 aa  523  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.2 
 
 		 946 aa  471  1.0000000000000001e-131  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.14 
 
 		 768 aa  434  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.84 
 
 		 742 aa  332  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.15 
 
 		 739 aa  329  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.68 
 
 		 746 aa  326  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.93 
 
 		 742 aa  324  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.55 
 
 		 765 aa  318  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.76 
 
 		 739 aa  315  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.76 
 
 		 739 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.97 
 
 		 739 aa  314  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.63 
 
 		 739 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.76 
 
 		 739 aa  313  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.76 
 
 		 739 aa  313  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.76 
 
 		 739 aa  313  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.76 
 
 		 739 aa  313  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.28 
 
 		 759 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.63 
 
 		 739 aa  313  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.63 
 
 		 739 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.83 
 
 		 798 aa  311  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.5 
 
 		 739 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.19 
 
 		 767 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  32.19 
 
 		 727 aa  307  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.78 
 
 		 738 aa  307  7e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.19 
 
 		 794 aa  305  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.68 
 
 		 772 aa  305  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.57 
 
 		 751 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.12 
 
 		 758 aa  304  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.75 
 
 		 743 aa  303  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.65 
 
 		 759 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.87 
 
 		 733 aa  302  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.02 
 
 		 777 aa  301  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.61 
 
 		 759 aa  301  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.52 
 
 		 752 aa  300  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2364  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.4 
 
 		 774 aa  300  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.137182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.3 
 
 		 761 aa  300  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.09 
 
 		 765 aa  297  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.31 
 
 		 751 aa  296  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.47 
 
 		 754 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.42 
 
 		 787 aa  296  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4068  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.43 
 
 		 772 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.89 
 
 		 769 aa  294  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.24 
 
 		 764 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.11 
 
 		 761 aa  293  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30 
 
 		 734 aa  292  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.25 
 
 		 769 aa  292  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.47 
 
 		 766 aa  291  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.84 
 
 		 764 aa  291  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.11 
 
 		 715 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.13 
 
 		 777 aa  290  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.09 
 
 		 754 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.5 
 
 		 742 aa  288  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.6 
 
 		 761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.15 
 
 		 782 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.77 
 
 		 768 aa  288  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.84 
 
 		 737 aa  288  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.74 
 
 		 760 aa  287  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.32 
 
 		 767 aa  288  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.2 
 
 		 764 aa  288  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.31 
 
 		 741 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.74 
 
 		 741 aa  287  5.999999999999999e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.36 
 
 		 737 aa  287  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>