More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1634 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.9 
 
 		 985 aa  695    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.47 
 
 		 953 aa  780    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  100 
 
 		 996 aa  2043    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.42 
 
 		 989 aa  770    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.49 
 
 		 998 aa  811    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  46.45 
 
 		 1032 aa  657    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.54 
 
 		 982 aa  715    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.15 
 
 		 953 aa  771    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.65 
 
 		 989 aa  767    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.4 
 
 		 1004 aa  677    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  76.2 
 
 		 996 aa  1560    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  74.2 
 
 		 996 aa  1552    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.56 
 
 		 966 aa  749    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  68.57 
 
 		 1020 aa  1402    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  83.13 
 
 		 996 aa  1741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.82 
 
 		 993 aa  1150    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.19 
 
 		 979 aa  765    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.07 
 
 		 1007 aa  664    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.27 
 
 		 981 aa  682    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.33 
 
 		 999 aa  1055    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  59.11 
 
 		 1004 aa  1153    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  56.41 
 
 		 995 aa  1117    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.05 
 
 		 973 aa  657    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.25 
 
 		 953 aa  758    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.19 
 
 		 979 aa  783    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.75 
 
 		 989 aa  769    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.04 
 
 		 1009 aa  787    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.97 
 
 		 993 aa  734    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  77.31 
 
 		 996 aa  1605    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.23 
 
 		 959 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  76.1 
 
 		 996 aa  1556    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  77.61 
 
 		 996 aa  1603    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  59.68 
 
 		 993 aa  1166    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.15 
 
 		 993 aa  1149    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.59 
 
 		 962 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.87 
 
 		 947 aa  581  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.44 
 
 		 945 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.8 
 
 		 800 aa  550  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.2 
 
 		 766 aa  514  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.06 
 
 		 946 aa  463  1e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.1 
 
 		 768 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.98 
 
 		 742 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.83 
 
 		 765 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.3 
 
 		 742 aa  324  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  31.75 
 
 		 727 aa  317  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.75 
 
 		 739 aa  311  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.62 
 
 		 739 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.62 
 
 		 739 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.49 
 
 		 739 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.49 
 
 		 739 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.72 
 
 		 739 aa  308  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.62 
 
 		 739 aa  307  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.36 
 
 		 739 aa  307  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.62 
 
 		 739 aa  307  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.62 
 
 		 739 aa  307  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.62 
 
 		 739 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.67 
 
 		 751 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.39 
 
 		 733 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.9 
 
 		 733 aa  305  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.55 
 
 		 746 aa  304  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33 
 
 		 798 aa  304  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.35 
 
 		 739 aa  304  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.33 
 
 		 758 aa  304  7.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.78 
 
 		 758 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.61 
 
 		 743 aa  302  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.92 
 
 		 765 aa  299  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.94 
 
 		 772 aa  300  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.69 
 
 		 733 aa  296  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.8 
 
 		 764 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.09 
 
 		 769 aa  295  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.23 
 
 		 761 aa  293  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.66 
 
 		 752 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.77 
 
 		 741 aa  292  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.13 
 
 		 737 aa  293  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.78 
 
 		 777 aa  292  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.92 
 
 		 737 aa  291  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.26 
 
 		 736 aa  290  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.7 
 
 		 764 aa  290  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.7 
 
 		 767 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.94 
 
 		 781 aa  290  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.56 
 
 		 764 aa  290  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.88 
 
 		 755 aa  289  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2364  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.63 
 
 		 774 aa  288  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.137182 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.69 
 
 		 794 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.18 
 
 		 761 aa  287  5.999999999999999e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.53 
 
 		 754 aa  287  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.12 
 
 		 754 aa  287  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.18 
 
 		 766 aa  286  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.2 
 
 		 777 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.33 
 
 		 767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.77 
 
 		 1256 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.9 
 
 		 759 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.36 
 
 		 734 aa  284  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.84 
 
 		 738 aa  283  8.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.91 
 
 		 737 aa  283  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.58 
 
 		 751 aa  282  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.2 
 
 		 769 aa  281  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.06 
 
 		 741 aa  280  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4546  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.89 
 
 		 768 aa  280  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.89 
 
 		 768 aa  280  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>