More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0554 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.34 
 
 		 1293 aa  1456    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  47.62 
 
 		 1241 aa  1157    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 1256 aa  2590    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.42 
 
 		 1254 aa  1346    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.92 
 
 		 1238 aa  1389    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.53 
 
 		 1631 aa  988    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  56.34 
 
 		 1231 aa  1417    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.01 
 
 		 1252 aa  1332    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.9 
 
 		 1251 aa  1396    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.57 
 
 		 1244 aa  1369    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.2 
 
 		 1266 aa  1462    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.66 
 
 		 1266 aa  1469    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  65.29 
 
 		 1284 aa  1771    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  47.9 
 
 		 1241 aa  1161    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.82 
 
 		 1244 aa  1419    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.01 
 
 		 1256 aa  1787    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.72 
 
 		 1243 aa  1395    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.68 
 
 		 1236 aa  1271    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.51 
 
 		 1251 aa  1342    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.66 
 
 		 962 aa  339  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.12 
 
 		 945 aa  333  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.99 
 
 		 947 aa  324  8e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.89 
 
 		 966 aa  301  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.09 
 
 		 953 aa  300  9e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.92 
 
 		 985 aa  300  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.4 
 
 		 953 aa  298  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.14 
 
 		 953 aa  298  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.88 
 
 		 996 aa  298  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.23 
 
 		 973 aa  292  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.51 
 
 		 959 aa  291  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.29 
 
 		 996 aa  281  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  26.48 
 
 		 996 aa  281  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.72 
 
 		 981 aa  280  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.96 
 
 		 996 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  26.76 
 
 		 996 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.29 
 
 		 1004 aa  273  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  26.5 
 
 		 1020 aa  271  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.08 
 
 		 993 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.55 
 
 		 766 aa  259  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.7 
 
 		 996 aa  254  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.51 
 
 		 995 aa  253  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.95 
 
 		 996 aa  252  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.14 
 
 		 979 aa  250  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.46 
 
 		 993 aa  245  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.7 
 
 		 979 aa  243  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.19 
 
 		 993 aa  243  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.98 
 
 		 989 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.06 
 
 		 989 aa  235  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.24 
 
 		 982 aa  233  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.06 
 
 		 989 aa  233  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.13 
 
 		 999 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.29 
 
 		 800 aa  225  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.57 
 
 		 768 aa  214  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.37 
 
 		 1004 aa  213  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.19 
 
 		 1341 aa  209  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  25.6 
 
 		 1032 aa  207  7e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.72 
 
 		 993 aa  207  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.32 
 
 		 1293 aa  206  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.21 
 
 		 1297 aa  205  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.21 
 
 		 1298 aa  205  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.42 
 
 		 1221 aa  205  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.78 
 
 		 1234 aa  204  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.82 
 
 		 1007 aa  204  9e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.9 
 
 		 1293 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.94 
 
 		 998 aa  199  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.74 
 
 		 1293 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.06 
 
 		 946 aa  198  5.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.81 
 
 		 1293 aa  198  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.96 
 
 		 1309 aa  197  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.9 
 
 		 1293 aa  197  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.59 
 
 		 1217 aa  197  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.99 
 
 		 1293 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.74 
 
 		 1301 aa  197  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.9 
 
 		 1293 aa  196  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.99 
 
 		 1293 aa  196  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.14 
 
 		 1293 aa  195  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.99 
 
 		 1293 aa  195  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.79 
 
 		 1293 aa  194  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.85 
 
 		 1293 aa  194  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.9 
 
 		 1293 aa  194  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.9 
 
 		 1297 aa  194  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.96 
 
 		 1293 aa  193  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.83 
 
 		 1293 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.15 
 
 		 751 aa  191  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.72 
 
 		 1297 aa  189  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.83 
 
 		 1295 aa  188  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2922  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.87 
 
 		 1295 aa  188  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.78 
 
 		 1295 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1111  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.68 
 
 		 1295 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.503937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3792  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.76 
 
 		 1295 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.753577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.76 
 
 		 1295 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0208  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.71 
 
 		 1345 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.85 
 
 		 1295 aa  186  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3113  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.21 
 
 		 1295 aa  186  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.34 
 
 		 1291 aa  185  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.86 
 
 		 1009 aa  185  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.42 
 
 		 1313 aa  184  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2842  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.76 
 
 		 1295 aa  184  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3203  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.46 
 
 		 1311 aa  184  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1761  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.35 
 
 		 1336 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.219026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>