More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0300 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  49.2 
 
 
1236 aa  1207    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  47.91 
 
 
1241 aa  1130    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.12 
 
 
1252 aa  1188    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  59.46 
 
 
1244 aa  1459    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.15 
 
 
1256 aa  1435    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  59.14 
 
 
1251 aa  1470    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.89 
 
 
1243 aa  1437    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.18 
 
 
1251 aa  1437    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.9 
 
 
1293 aa  1320    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.06 
 
 
1254 aa  1402    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.32 
 
 
1266 aa  1310    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.48 
 
 
1266 aa  1310    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.11 
 
 
1284 aa  1381    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.68 
 
 
1631 aa  1065    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  48.15 
 
 
1241 aa  1129    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.48 
 
 
1244 aa  1230    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  59.08 
 
 
1238 aa  1454    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  56.34 
 
 
1256 aa  1417    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  100 
 
 
1231 aa  2530    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.91 
 
 
947 aa  289  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.27 
 
 
962 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.56 
 
 
945 aa  271  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.68 
 
 
985 aa  266  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28 
 
 
981 aa  263  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.13 
 
 
973 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.91 
 
 
966 aa  260  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.58 
 
 
959 aa  253  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.14 
 
 
953 aa  251  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.77 
 
 
953 aa  249  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.81 
 
 
953 aa  245  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.79 
 
 
766 aa  231  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.68 
 
 
989 aa  225  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.73 
 
 
989 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.62 
 
 
989 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.26 
 
 
996 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.53 
 
 
979 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  26.17 
 
 
996 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.22 
 
 
979 aa  215  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.71 
 
 
996 aa  214  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.7 
 
 
982 aa  213  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25 
 
 
995 aa  212  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.37 
 
 
993 aa  208  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  25.95 
 
 
1020 aa  205  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.11 
 
 
1004 aa  202  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.65 
 
 
993 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  25.33 
 
 
1032 aa  199  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.05 
 
 
996 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.29 
 
 
996 aa  199  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.95 
 
 
993 aa  196  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  24.97 
 
 
996 aa  195  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.01 
 
 
800 aa  193  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.89 
 
 
993 aa  193  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39660  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.66 
 
 
1298 aa  192  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.04 
 
 
1299 aa  192  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.16 
 
 
1299 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.84 
 
 
996 aa  191  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.14 
 
 
1299 aa  191  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.06 
 
 
999 aa  190  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.21 
 
 
768 aa  187  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1037  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.88 
 
 
1299 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.02 
 
 
1301 aa  186  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.56 
 
 
1217 aa  186  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.87 
 
 
1298 aa  184  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.97 
 
 
1292 aa  184  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15740  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.94 
 
 
1298 aa  182  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.989806  hitchhiker  0.000000174992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.13 
 
 
1298 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.69 
 
 
1221 aa  181  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.68 
 
 
946 aa  180  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.44 
 
 
1007 aa  178  5e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.89 
 
 
1295 aa  178  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.6 
 
 
751 aa  177  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.56 
 
 
1291 aa  177  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.11 
 
 
1298 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.63 
 
 
1004 aa  177  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.43 
 
 
1297 aa  177  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.81 
 
 
1297 aa  174  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.61 
 
 
1293 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.37 
 
 
1298 aa  174  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.18 
 
 
758 aa  173  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1582  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.99 
 
 
1344 aa  173  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.503606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.37 
 
 
1297 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.67 
 
 
1299 aa  173  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.83 
 
 
1223 aa  173  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.78 
 
 
1296 aa  172  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3052  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.39 
 
 
1295 aa  172  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.55 
 
 
1306 aa  172  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.36 
 
 
1313 aa  172  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.32 
 
 
1293 aa  171  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.89 
 
 
1293 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1223  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.73 
 
 
1295 aa  171  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.76 
 
 
1293 aa  170  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.89 
 
 
1293 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.6 
 
 
1234 aa  169  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.29 
 
 
1293 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.93 
 
 
1298 aa  169  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.82 
 
 
1293 aa  169  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.67 
 
 
1293 aa  169  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.98 
 
 
1295 aa  168  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.78 
 
 
998 aa  167  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.71 
 
 
765 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>